254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0284 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  100 
 
 		 202 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  91.5 
 
 		 211 aa  350  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  80.3 
 
 		 204 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  77 
 
 		 204 aa  312  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  73.02 
 
 		 210 aa  276  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  70.53 
 
 		 251 aa  266  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0548  lipolytic enzyme, G-D-S-L  70.47 
 
 		 227 aa  251  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.386484  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  63.64 
 
 		 218 aa  235  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  61.88 
 
 		 240 aa  232  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  64.61 
 
 		 257 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  62.78 
 
 		 216 aa  230  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  58.73 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  61.29 
 
 		 216 aa  229  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  59.34 
 
 		 241 aa  229  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  57.84 
 
 		 239 aa  226  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  58.79 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  58.92 
 
 		 213 aa  218  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  59.24 
 
 		 201 aa  217  8.999999999999998e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  55 
 
 		 255 aa  214  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  55.72 
 
 		 226 aa  214  5.9999999999999996e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  57.38 
 
 		 226 aa  213  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  56.99 
 
 		 248 aa  212  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  55.56 
 
 		 214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  55.03 
 
 		 214 aa  210  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1921  lipolytic protein G-D-S-L family  58.01 
 
 		 198 aa  208  4e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  52.88 
 
 		 255 aa  200  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  53 
 
 		 240 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  49.21 
 
 		 211 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  51.69 
 
 		 214 aa  180  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  50.29 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  47.57 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  48.19 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  46.07 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  46.6 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  47.15 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  50 
 
 		 209 aa  168  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1278  GDSL family lipase  48.04 
 
 		 223 aa  168  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398687  normal  0.0389661 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  43.16 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  45.66 
 
 		 223 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  46.63 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  46.24 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  43.52 
 
 		 266 aa  153  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  43.88 
 
 		 270 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  42.54 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  44.32 
 
 		 270 aa  150  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  42.11 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  43.33 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  43.09 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1973  arylesterase  44.44 
 
 		 208 aa  145  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  42.7 
 
 		 201 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  41.57 
 
 		 205 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  43.55 
 
 		 216 aa  144  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2130  acyl-CoA thioesterase I  45.11 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0925332  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1912  Arylesterase  42.56 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6500  lipolytic protein G-D-S-L family  42.29 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  42.19 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1355  GDSL family lipase  45 
 
 		 184 aa  142  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260429  normal  0.647908 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2141  GDSL family lipase  43.92 
 
 		 192 aa  141  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.336589  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2289  arylesterase  42.78 
 
 		 208 aa  141  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85039  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  42.19 
 
 		 201 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1017  lysophospholipase  43.55 
 
 		 214 aa  140  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  41.58 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2311  acyl-CoA thioesterase I  44.57 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1599  lipolytic protein G-D-S-L family  38.33 
 
 		 222 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1451  acyl-CoA thioesterase I  44.57 
 
 		 210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0796987  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1384  arylesterase  44.62 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.015235  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  41.57 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1944  acyl-CoA thioesterase, putative  44.57 
 
 		 210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3360  acyl-CoA thioesterase I  44.57 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.323811  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1219  acyl-CoA thioesterase, putative  44.57 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2468  acyl-CoA thioesterase I  44.57 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2349  acyl-CoA thioesterase I  44.57 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342974  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  40.31 
 
 		 202 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1152  lipolytic enzyme, G-D-S-L  45.29 
 
 		 227 aa  138  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  41.62 
 
 		 205 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1919  GDSL family lipase  41.97 
 
 		 222 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1044  arylesterase  40.66 
 
 		 213 aa  137  7.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1942  GDSL family lipase  41.45 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1907  arylesterase  42.22 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0973047  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1837  lysophospholipase  42.22 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal  0.074561 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00445  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  47.17 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00450  hypothetical protein  47.17 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1250  arylesterase  38.17 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23070  Arylesterase protein  43.26 
 
 		 198 aa  136  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.803817  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3116  Lysophospholipase  47.17 
 
 		 197 aa  135  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  40.64 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5220  lipolytic protein  42.7 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0543  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  47.17 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6160  lipolytic enzyme, G-D-S-L  42.7 
 
 		 184 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3122  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  47.17 
 
 		 197 aa  135  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0574  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  47.17 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0429  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  47.17 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0533  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  47.17 
 
 		 218 aa  135  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  41.18 
 
 		 201 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2242  Arylesterase  43.89 
 
 		 200 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0186506  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  41.46 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0700  lipolytic enzyme, G-D-S-L  45.6 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.948885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0968  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  46.54 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1271  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  45.91 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.934354  normal  0.745866 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  41.18 
 
 		 201 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>