245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2318 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  100 
 
 
201 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  99 
 
 
201 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  95.98 
 
 
199 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  94.03 
 
 
201 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  79.1 
 
 
201 aa  330  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  77.61 
 
 
201 aa  317  7e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  78.89 
 
 
205 aa  296  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  75.62 
 
 
201 aa  294  5e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  72.14 
 
 
201 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  70.65 
 
 
201 aa  280  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23070  Arylesterase protein  69.63 
 
 
198 aa  254  7e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.803817  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  52.68 
 
 
212 aa  216  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1044  arylesterase  54.64 
 
 
213 aa  208  5e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1250  arylesterase  51.74 
 
 
208 aa  207  6e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1401  arylesterase  61.5 
 
 
226 aa  204  7e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2620  arylesterase  55.8 
 
 
194 aa  203  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403084  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2242  Arylesterase  55.79 
 
 
200 aa  201  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0186506  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5220  lipolytic protein  57.3 
 
 
224 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  53.89 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0651  Lysophospholipase  54.95 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.623159  normal  0.969568 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2289  arylesterase  53.3 
 
 
208 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85039  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  55.62 
 
 
216 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  55.62 
 
 
205 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1912  Arylesterase  52.15 
 
 
224 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1919  GDSL family lipase  54.3 
 
 
222 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1942  GDSL family lipase  55.62 
 
 
222 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6160  lipolytic enzyme, G-D-S-L  56.18 
 
 
184 aa  197  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2311  acyl-CoA thioesterase I  54.49 
 
 
226 aa  197  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328666  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  52.72 
 
 
202 aa  197  9e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2468  acyl-CoA thioesterase I  54.19 
 
 
232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1017  lysophospholipase  52.15 
 
 
214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1881  lipolytic protein  52.69 
 
 
226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0892024  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3360  acyl-CoA thioesterase I  54.49 
 
 
226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.323811  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2349  acyl-CoA thioesterase I  54.49 
 
 
226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342974  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1219  acyl-CoA thioesterase, putative  54.49 
 
 
226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1451  acyl-CoA thioesterase I  54.19 
 
 
210 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0796987  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1837  lysophospholipase  55.62 
 
 
201 aa  195  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal  0.074561 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1907  arylesterase  55.62 
 
 
225 aa  195  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0973047  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1944  acyl-CoA thioesterase, putative  54.19 
 
 
210 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2130  acyl-CoA thioesterase I  52.81 
 
 
232 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0925332  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1815  acyl-CoA thioesterase I precursor  51.27 
 
 
216 aa  194  7e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4035  arylesterase  50 
 
 
214 aa  194  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0926755 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1355  GDSL family lipase  53.98 
 
 
184 aa  192  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260429  normal  0.647908 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1603  lipolytic protein G-D-S-L family  53.8 
 
 
215 aa  190  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2271  GDSL family lipase  53.8 
 
 
215 aa  190  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.806059  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0549  arylesterase  49.46 
 
 
219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.65296  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3444  arylesterase  50 
 
 
214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000206648 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04660  acyl-CoA thioesterase I  53.01 
 
 
217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0171424  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2928  acyl-CoA thioesterase I, putative  48.86 
 
 
227 aa  186  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1384  arylesterase  52.25 
 
 
201 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.015235  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2409  arylesterase  51.1 
 
 
204 aa  185  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170275 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2068  arylesterase  45.7 
 
 
217 aa  184  6e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1888  GDSL family lipase  50 
 
 
205 aa  184  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.172385  normal  0.431638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3020  GDSL family lipase  52.2 
 
 
221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.242695 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2714  lipolytic protein  49.49 
 
 
200 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345336 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1973  arylesterase  46.77 
 
 
208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1054  Lysophospholipase  52.49 
 
 
212 aa  181  8.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0010  Arylesterase  49.73 
 
 
228 aa  180  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.939172  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  47.15 
 
 
219 aa  180  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1478  arylesterase  47.78 
 
 
199 aa  180  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1543  arylesterase  47.78 
 
 
199 aa  180  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  47.28 
 
 
195 aa  180  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1537  GDSL family lipase  47.78 
 
 
199 aa  180  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131898 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  49.17 
 
 
215 aa  179  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1696  arylesterase  46.28 
 
 
198 aa  179  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.122865  normal  0.277119 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2368  arylesterase  51.43 
 
 
188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3031  arylesterase  51.27 
 
 
202 aa  176  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0119221  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2205  Arylesterase  49.72 
 
 
185 aa  176  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  45.31 
 
 
209 aa  176  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2403  arylesterase  47.09 
 
 
197 aa  175  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  50 
 
 
200 aa  174  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3412  arylesterase  50.83 
 
 
182 aa  174  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.634502  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2898  arylesterase  46.63 
 
 
190 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179811  hitchhiker  0.000609296 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  48.3 
 
 
200 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2392  arylesterase  46.02 
 
 
199 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2785  arylesterase  48 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.761375  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2709  arylesterase  48 
 
 
216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1678  Arylesterase  48 
 
 
185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740826  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1122  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  46.81 
 
 
197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0118083  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2688  arylesterase  48.54 
 
 
199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3193  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  46.81 
 
 
197 aa  171  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.194164  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0615  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  48.63 
 
 
204 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.382556  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0561  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  48.63 
 
 
204 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.868884  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0571  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  48.63 
 
 
204 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0556  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  48.63 
 
 
204 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0554  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  48.63 
 
 
204 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1271  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  48.65 
 
 
216 aa  170  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.934354  normal  0.745866 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  43.72 
 
 
255 aa  170  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3159  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  48.65 
 
 
190 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.681628  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3021  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  48.65 
 
 
211 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.116917  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1157  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  49.72 
 
 
196 aa  169  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.987019  hitchhiker  0.000093812 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0686  acyl-CoA thioesterase I precursor  46.74 
 
 
206 aa  169  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2424  lipolytic enzyme, G-D-S-L  47.75 
 
 
178 aa  169  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2914  arylesterase  46.99 
 
 
212 aa  169  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00445  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  48.09 
 
 
208 aa  168  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00450  hypothetical protein  48.09 
 
 
208 aa  168  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0533  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  48.09 
 
 
218 aa  168  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0543  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  48.09 
 
 
207 aa  168  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0429  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  48.09 
 
 
207 aa  168  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0574  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  48.09 
 
 
207 aa  168  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>