228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0548 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0548  lipolytic enzyme, G-D-S-L  100 
 
 		 227 aa  455  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.386484  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  76.79 
 
 		 251 aa  323  1e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  70.21 
 
 		 204 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  73.89 
 
 		 210 aa  276  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  70.47 
 
 		 202 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  71.51 
 
 		 204 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  70.05 
 
 		 211 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  63.29 
 
 		 218 aa  246  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  62.56 
 
 		 216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  62.56 
 
 		 216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  57.69 
 
 		 213 aa  237  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  52.17 
 
 		 239 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  60.7 
 
 		 240 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  58.88 
 
 		 241 aa  229  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  58.38 
 
 		 241 aa  226  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  58.94 
 
 		 213 aa  225  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  59.34 
 
 		 255 aa  222  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  59.28 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  64.61 
 
 		 257 aa  218  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  52.8 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  58.33 
 
 		 201 aa  215  5e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1921  lipolytic protein G-D-S-L family  60.33 
 
 		 198 aa  209  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  56.41 
 
 		 214 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  57.22 
 
 		 214 aa  207  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  56.38 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  50.47 
 
 		 226 aa  205  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  55.93 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  53.01 
 
 		 214 aa  177  9e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  48.98 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  47.96 
 
 		 208 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1278  GDSL family lipase  48.68 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398687  normal  0.0389661 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  49.71 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  47.45 
 
 		 208 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  46.31 
 
 		 216 aa  168  6e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  46.89 
 
 		 252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  44.79 
 
 		 266 aa  161  9e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  44.2 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  49.21 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  44.62 
 
 		 270 aa  157  9e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  43.93 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  45.09 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  44.09 
 
 		 270 aa  155  7e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0700  lipolytic enzyme, G-D-S-L  48.45 
 
 		 237 aa  154  9e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.948885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  45.96 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  42.05 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  45.45 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  43.33 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1942  GDSL family lipase  40.99 
 
 		 222 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  37.45 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  43.09 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1919  GDSL family lipase  40.59 
 
 		 222 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  41.76 
 
 		 212 aa  138  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  40.93 
 
 		 202 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1599  lipolytic protein G-D-S-L family  37.99 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0571  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  38.71 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0615  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  38.71 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.382556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0554  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  38.71 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0561  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  38.71 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.868884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0556  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  38.71 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1973  arylesterase  41.3 
 
 		 208 aa  134  8e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00445  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  40.59 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1912  Arylesterase  39.2 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00450  hypothetical protein  40.59 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  41.21 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0429  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  40.59 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0543  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  40.59 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0533  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  40.59 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0574  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  40.59 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2289  arylesterase  39.78 
 
 		 208 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85039  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1044  arylesterase  39.44 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  41.34 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  39.02 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5220  lipolytic protein  40.54 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6160  lipolytic enzyme, G-D-S-L  40.54 
 
 		 184 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  39.59 
 
 		 199 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1355  GDSL family lipase  41.08 
 
 		 184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260429  normal  0.647908 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1907  arylesterase  38.54 
 
 		 225 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0973047  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  36.49 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0598  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  40.1 
 
 		 207 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.79584 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1837  lysophospholipase  38.02 
 
 		 201 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal  0.074561 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  42.22 
 
 		 219 aa  131  7.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  39.02 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  39.8 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0010  Arylesterase  41.34 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.939172  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0285  arylesterase precursor  33.82 
 
 		 206 aa  129  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0968  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  40.2 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3116  Lysophospholipase  41.76 
 
 		 197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3122  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  41.76 
 
 		 197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  38.07 
 
 		 201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1152  lipolytic enzyme, G-D-S-L  44.09 
 
 		 227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1384  arylesterase  40.45 
 
 		 201 aa  128  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.015235  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1017  lysophospholipase  39.67 
 
 		 214 aa  128  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6500  lipolytic protein G-D-S-L family  38.46 
 
 		 237 aa  128  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23070  Arylesterase protein  41.01 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.803817  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  38.92 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3021  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  41.18 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.116917  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1271  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  41.67 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.934354  normal  0.745866 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3159  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  41.18 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.681628  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2130  acyl-CoA thioesterase I  39.44 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0925332  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2242  Arylesterase  44.12 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0186506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>