248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3994 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  100 
 
 		 216 aa  427  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  99.54 
 
 		 216 aa  423  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  91.71 
 
 		 218 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  74.02 
 
 		 240 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  74.73 
 
 		 257 aa  272  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  69.9 
 
 		 255 aa  269  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  67.36 
 
 		 204 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  64.77 
 
 		 213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  60.22 
 
 		 204 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  59.18 
 
 		 213 aa  230  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  58.92 
 
 		 239 aa  229  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  61.29 
 
 		 202 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1921  lipolytic protein G-D-S-L family  62.3 
 
 		 198 aa  228  5e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  61.41 
 
 		 211 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  62.11 
 
 		 210 aa  228  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  62.7 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0548  lipolytic enzyme, G-D-S-L  62.56 
 
 		 227 aa  226  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.386484  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  58.38 
 
 		 241 aa  224  9e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  57.42 
 
 		 248 aa  224  9e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  57.84 
 
 		 241 aa  222  4e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  55.24 
 
 		 226 aa  222  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  56.57 
 
 		 214 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  57.07 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  56.32 
 
 		 214 aa  207  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  58.24 
 
 		 201 aa  207  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  54.44 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  50 
 
 		 216 aa  181  7e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  53.93 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  44.76 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  48.55 
 
 		 223 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  51.04 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  51.34 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  49.13 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  45.23 
 
 		 252 aa  160  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1152  lipolytic enzyme, G-D-S-L  49.11 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  44.97 
 
 		 233 aa  158  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  43.07 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  43.07 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  44.68 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  44.86 
 
 		 266 aa  151  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0700  lipolytic enzyme, G-D-S-L  46.74 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.948885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  41.63 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  41.8 
 
 		 270 aa  145  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  44.15 
 
 		 228 aa  145  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  41.29 
 
 		 270 aa  144  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  42.63 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1278  GDSL family lipase  43.07 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398687  normal  0.0389661 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1973  arylesterase  42.63 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  43.09 
 
 		 234 aa  136  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1599  lipolytic protein G-D-S-L family  36.96 
 
 		 222 aa  134  7.000000000000001e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0267  lipolytic protein G-D-S-L family  41.51 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151639 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2141  GDSL family lipase  42.31 
 
 		 192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.336589  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  38.46 
 
 		 195 aa  131  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  37.78 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1250  arylesterase  40.59 
 
 		 208 aa  128  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  39.67 
 
 		 212 aa  125  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  38.2 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  36.41 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  40.25 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6500  lipolytic protein G-D-S-L family  39.23 
 
 		 237 aa  118  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  39.66 
 
 		 201 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  40.37 
 
 		 215 aa  117  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3444  arylesterase  36.32 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000206648 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1837  lysophospholipase  36.22 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal  0.074561 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1907  arylesterase  36.22 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0973047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  37.93 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  38.51 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  37.93 
 
 		 200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1044  arylesterase  35.91 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1942  GDSL family lipase  35.98 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0285  arylesterase precursor  34.13 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1919  GDSL family lipase  35.82 
 
 		 222 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  36.52 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1242  GDSL family lipase  40.21 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189658  normal  0.178592 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2068  arylesterase  37.63 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  36.6 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  35.96 
 
 		 201 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  37.08 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6160  lipolytic enzyme, G-D-S-L  36.02 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  36.52 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5220  lipolytic protein  36.02 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1912  Arylesterase  33.33 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2289  arylesterase  34.3 
 
 		 208 aa  111  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85039  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2242  Arylesterase  37.64 
 
 		 200 aa  112  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0186506  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2959  arylesterase  34.83 
 
 		 202 aa  112  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1355  GDSL family lipase  35.48 
 
 		 184 aa  111  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260429  normal  0.647908 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  37.1 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  34.9 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1054  Lysophospholipase  35.91 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3116  Lysophospholipase  40.88 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  36.76 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1017  lysophospholipase  35.39 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0554  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  37.99 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0615  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  37.99 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.382556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0571  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  37.99 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  34.78 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0561  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  37.99 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.868884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0556  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  37.99 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3122  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  40.88 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0429  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  40.88 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>