63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3405 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3405  lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  100 
 
 		 244 aa  476  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1368  hypothetical protein  55.5 
 
 		 249 aa  184  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15910  hypothetical protein  54 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.165827 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2127  GDSL family lipase  40.51 
 
 		 246 aa  136  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169473  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0498  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.58 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0149  hypothetical protein  38.99 
 
 		 235 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2906  hypothetical protein  38.99 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0162  hypothetical protein  38.53 
 
 		 235 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1853  GDSL family lipase  33.06 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211701 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0124  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  38.94 
 
 		 267 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3000  hypothetical protein  38.94 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3328  hypothetical protein  38.07 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0136  hypothetical protein  38.14 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3065  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  38.64 
 
 		 244 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3305  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  38.64 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3993  lipolytic enzyme, G-D-S-L  38.64 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3921  lipolytic enzyme, G-D-S-L  38.64 
 
 		 244 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619523  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3258  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  37.73 
 
 		 258 aa  92.4  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0148  hypothetical protein  37.21 
 
 		 240 aa  92  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3261  hypothetical protein  31.56 
 
 		 250 aa  89  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3142  hypothetical protein  33.69 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.917118  normal  0.0747759 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2206  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.69 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0148894  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2616  GDSL family lipase  32.08 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2866  hypothetical protein  27.92 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2055  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  28.24 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1915  hypothetical protein  27.13 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000228464  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01055  hypothetical protein  32.58 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.411202  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  31.12 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4028  hypothetical protein  32.44 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  31.25 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4423  lipolytic protein G-D-S-L family  29.03 
 
 		 348 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0082  lipolytic protein G-D-S-L family  33.16 
 
 		 351 aa  65.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0910  GDSL family lipase  29.63 
 
 		 361 aa  65.5  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3985  GDSL family lipase  31.4 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0334981  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0938  GDSL family lipase  29.67 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  26.17 
 
 		 324 aa  62  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0853  GDSL family lipase  30.28 
 
 		 361 aa  62  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0909  GDSL family lipase  33.84 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1908  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.42 
 
 		 267 aa  55.1  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000035223  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0852  GDSL family lipase  31.96 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1032  lysophospholipase  23.35 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4226  GDSL family lipase  24.6 
 
 		 318 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.558892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4151  lipolytic enzyme, G-D-S-L  24.6 
 
 		 318 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1537  hypothetical protein  50.65 
 
 		 82 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4382  GDSL family lipase  24.06 
 
 		 318 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11093  hypothetical protein  25.28 
 
 		 314 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.963411 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  27.59 
 
 		 368 aa  48.5  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1616  lipolytic protein G-D-S-L family  26.21 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  27.27 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2041  GDSL family lipase  24.18 
 
 		 320 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23917  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  23.2 
 
 		 305 aa  46.2  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0437  putative secreted protein  29.51 
 
 		 347 aa  45.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0643  lipolytic protein G-D-S-L family  28.57 
 
 		 376 aa  45.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  25.96 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2484  GDSL family lipase  30.65 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0068  lipolytic protein  28.67 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523857  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2667  GDSL family lipase  29.79 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24646  hitchhiker  0.000175501 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  27.33 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0086  lipolytic protein G-D-S-L family  27.33 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1538  hypothetical protein  33.72 
 
 		 125 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.313345  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26633  predicted protein  23.42 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4676  GDSL family lipase  24.88 
 
 		 320 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.694492 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21100  lysophospholipase L1-like esterase  27.04 
 
 		 223 aa  43.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>