66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2484 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2484  GDSL family lipase  100 
 
 
234 aa  464  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2667  GDSL family lipase  84.85 
 
 
234 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24646  hitchhiker  0.000175501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3268  lipolytic protein G-D-S-L family  53.64 
 
 
232 aa  219  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0156  lipolytic protein G-D-S-L family  46.19 
 
 
256 aa  172  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0132621  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3278  hypothetical protein  38.64 
 
 
229 aa  155  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  33.84 
 
 
210 aa  106  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1363  lipolytic protein G-D-S-L family  34.67 
 
 
289 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  28.49 
 
 
196 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  40.11 
 
 
270 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1326  GDSL family lipase  34.17 
 
 
287 aa  92.8  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0072  GDSL family lipase  33.51 
 
 
294 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  26.26 
 
 
196 aa  89  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  26.82 
 
 
197 aa  88.6  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06060  lysophospholipase L1-like esterase  40.46 
 
 
297 aa  87.4  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105705  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  24.86 
 
 
211 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  31.63 
 
 
300 aa  87.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  33.16 
 
 
296 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  24.58 
 
 
197 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2206  lipolytic protein G-D-S-L family  34.83 
 
 
261 aa  85.9  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.235445 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  24.31 
 
 
211 aa  85.9  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  25.14 
 
 
197 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2954  lipolytic protein G-D-S-L family  31.84 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0263  lipolytic protein G-D-S-L family  31.68 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  24.58 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  24.58 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0855  hypothetical protein  32.07 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335493  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19770  lysophospholipase L1-like esterase  33.16 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  hitchhiker  0.000837214 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23280  lysophospholipase L1-like esterase  31.21 
 
 
290 aa  78.6  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3930  GDSL family lipase  31.82 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3925  GDSL family lipase  30.93 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0732  lipolytic protein G-D-S-L family  33.33 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1065  lipolytic protein G-D-S-L family  35.1 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4413  GDSL family lipase  31.82 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2321  lipase/acylhydrolase  29.75 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183981  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  33.15 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0684  lipolytic protein G-D-S-L family  33.97 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0974788  hitchhiker  0.0000166957 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3727  lipolytic protein G-D-S-L family  30.77 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  33.67 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2060  lipolytic protein G-D-S-L family  29.67 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6531  hypothetical protein  37.96 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.0269756 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0023  GDSL family lipase  33.16 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2928  GDSL family lipase  33.33 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2914  GDSL family lipase  33.33 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2884  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.33 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0469503  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34730  lysophospholipase L1-like esterase  32.14 
 
 
302 aa  71.6  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0437206  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2945  lipolytic protein G-D-S-L family  31.87 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31650  lysophospholipase L1-like esterase  36.08 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0027  GDSL family lipase  32.12 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2275  lipolytic protein G-D-S-L family  31.38 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0386  lipolytic protein G-D-S-L family  29.65 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3730  lipolytic protein G-D-S-L family  29.38 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1490  lipolytic protein G-D-S-L family  37.4 
 
 
264 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.2 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0731  lipolytic protein G-D-S-L family  29.9 
 
 
265 aa  65.5  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0811  lipolytic protein G-D-S-L family  30.9 
 
 
333 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.0157392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3183  GDSL family lipase  32.2 
 
 
256 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209984 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3065  lipolytic protein G-D-S-L family  30.88 
 
 
262 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5121  GDSL family lipase  28.5 
 
 
254 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245752  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21860  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  27.18 
 
 
307 aa  50.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00185801  normal  0.684974 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2933  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.41 
 
 
218 aa  48.5  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.594206  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.05 
 
 
270 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2237  GDSL family lipase  32.23 
 
 
284 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0161232 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3405  lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  30.65 
 
 
244 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  33.05 
 
 
270 aa  44.7  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  33.6 
 
 
202 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  29.82 
 
 
266 aa  42  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>