72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0909 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0909  GDSL family lipase  100 
 
 		 270 aa  519  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0852  GDSL family lipase  87.41 
 
 		 270 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0938  GDSL family lipase  47.09 
 
 		 348 aa  152  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  49.49 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0643  lipolytic protein G-D-S-L family  48 
 
 		 376 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  48.06 
 
 		 324 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0930  lipolytic protein G-D-S-L family  49.5 
 
 		 340 aa  132  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0853  GDSL family lipase  50.52 
 
 		 361 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0910  GDSL family lipase  49.75 
 
 		 361 aa  128  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  45.96 
 
 		 343 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  41.92 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0082  lipolytic protein G-D-S-L family  41.87 
 
 		 351 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3985  GDSL family lipase  42.26 
 
 		 298 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0334981  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  40.2 
 
 		 368 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4423  lipolytic protein G-D-S-L family  38.36 
 
 		 348 aa  113  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4382  GDSL family lipase  39.6 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4151  lipolytic enzyme, G-D-S-L  39.6 
 
 		 318 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4226  GDSL family lipase  39.6 
 
 		 318 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.558892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11093  hypothetical protein  44.69 
 
 		 314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.963411 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2041  GDSL family lipase  39.09 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23917  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0437  putative secreted protein  41 
 
 		 347 aa  105  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1616  lipolytic protein G-D-S-L family  42.42 
 
 		 305 aa  102  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4676  GDSL family lipase  39.43 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.694492 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3837  lipolytic protein G-D-S-L family  43.94 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.490417  normal  0.0238456 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1853  GDSL family lipase  30.96 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211701 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3405  lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  33.84 
 
 		 244 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2127  GDSL family lipase  28.99 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169473  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2140  lipolytic protein G-D-S-L family  39.29 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1368  hypothetical protein  32.5 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15910  hypothetical protein  31.34 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.165827 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  34.34 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0068  lipolytic protein  36.65 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523857  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3261  hypothetical protein  25.68 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2616  GDSL family lipase  29.11 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0498  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.56 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3142  hypothetical protein  28.88 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.917118  normal  0.0747759 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0148  hypothetical protein  31.56 
 
 		 240 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0136  hypothetical protein  32 
 
 		 240 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3258  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  30.9 
 
 		 258 aa  52.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3000  hypothetical protein  30.74 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0086  lipolytic protein G-D-S-L family  32.99 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0124  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  30.74 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3065  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  31.39 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2206  lipolytic enzyme, G-D-S-L  24.77 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0148894  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3921  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.39 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619523  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1915  hypothetical protein  27.45 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000228464  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1908  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.91 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000035223  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3305  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  32.3 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  33 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3993  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.25 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21100  lysophospholipase L1-like esterase  28.64 
 
 		 223 aa  50.4  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2055  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  27.07 
 
 		 264 aa  50.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2906  hypothetical protein  32.28 
 
 		 235 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  29.65 
 
 		 219 aa  48.9  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0162  hypothetical protein  32.28 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3012  lipolytic protein  28.94 
 
 		 383 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0149  hypothetical protein  32.28 
 
 		 235 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  30.43 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  22.82 
 
 		 220 aa  46.6  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3328  hypothetical protein  32.24 
 
 		 235 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  33.88 
 
 		 210 aa  46.2  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2205  G-D-S-L family lipolytic protein  26.92 
 
 		 372 aa  46.2  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0392417  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0436  GDSL family lipase  26.67 
 
 		 208 aa  45.8  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.633376  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2866  hypothetical protein  22.77 
 
 		 242 aa  43.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  24.27 
 
 		 216 aa  43.1  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  27.64 
 
 		 269 aa  43.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.5 
 
 		 270 aa  42.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0143  lipolytic protein G-D-S-L family  26.01 
 
 		 305 aa  42.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  28.03 
 
 		 225 aa  42.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3980  lipolytic protein G-D-S-L family  28.19 
 
 		 262 aa  42.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235003  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01055  hypothetical protein  26.29 
 
 		 217 aa  42.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.411202  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1746  GDSL family lipase  34.59 
 
 		 238 aa  42.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.761874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>