42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2206 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2206  lipolytic enzyme, G-D-S-L  100 
 
 
280 aa  577  1e-164  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0148894  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1915  hypothetical protein  86.43 
 
 
280 aa  486  1e-136  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000228464  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1853  GDSL family lipase  46.39 
 
 
263 aa  253  3e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211701 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0498  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.43 
 
 
238 aa  149  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2055  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  33.58 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2866  hypothetical protein  31.82 
 
 
242 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0136  hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0149  hypothetical protein  33.19 
 
 
235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3328  hypothetical protein  33.33 
 
 
235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2906  hypothetical protein  33.19 
 
 
235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0162  hypothetical protein  33.19 
 
 
235 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0148  hypothetical protein  32.91 
 
 
240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3258  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  32.91 
 
 
258 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3261  hypothetical protein  29.48 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3000  hypothetical protein  31.51 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3065  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  31.51 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3993  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.09 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3921  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.51 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619523  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3305  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  31.51 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0124  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  31.51 
 
 
267 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3142  hypothetical protein  29.96 
 
 
237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.917118  normal  0.0747759 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01055  hypothetical protein  34.89 
 
 
217 aa  112  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.411202  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1908  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.89 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000035223  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2127  GDSL family lipase  32.27 
 
 
246 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169473  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2616  GDSL family lipase  30.58 
 
 
225 aa  106  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4028  hypothetical protein  31.92 
 
 
280 aa  102  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012375 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3405  lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  29.46 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1368  hypothetical protein  26.79 
 
 
249 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15910  hypothetical protein  27.27 
 
 
249 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.165827 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0503  lipase/acylhydrolase  22.88 
 
 
279 aa  55.5  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4151  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.59 
 
 
318 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3985  GDSL family lipase  26.17 
 
 
298 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0334981  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4226  GDSL family lipase  27.59 
 
 
318 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.558892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4382  GDSL family lipase  27.59 
 
 
318 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1537  hypothetical protein  41.56 
 
 
82 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2041  GDSL family lipase  26.42 
 
 
320 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23917  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11093  hypothetical protein  24.24 
 
 
314 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.963411 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1538  hypothetical protein  25.23 
 
 
125 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.313345  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4676  GDSL family lipase  25.49 
 
 
320 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.694492 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02421  hypothetical protein  29.03 
 
 
212 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.564426  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0909  GDSL family lipase  23.83 
 
 
270 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  26.26 
 
 
305 aa  45.8  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>