54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0498 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0498  lipolytic enzyme, G-D-S-L  100 
 
 		 238 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3000  hypothetical protein  46.51 
 
 		 267 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0124  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  46.51 
 
 		 267 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3328  hypothetical protein  46.51 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3921  lipolytic enzyme, G-D-S-L  46.51 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619523  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3305  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  46.51 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3993  lipolytic enzyme, G-D-S-L  46.51 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3065  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  46.51 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3258  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  45.58 
 
 		 258 aa  204  7e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0148  hypothetical protein  46.05 
 
 		 240 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0149  hypothetical protein  46.05 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0136  hypothetical protein  45.12 
 
 		 240 aa  198  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0162  hypothetical protein  45.58 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2906  hypothetical protein  45.58 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2866  hypothetical protein  38.79 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3142  hypothetical protein  42.73 
 
 		 237 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.917118  normal  0.0747759 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3261  hypothetical protein  41.48 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2055  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  38.49 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2616  GDSL family lipase  39.19 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2206  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.43 
 
 		 280 aa  149  6e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0148894  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1915  hypothetical protein  33.33 
 
 		 280 aa  148  8e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000228464  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1908  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.84 
 
 		 267 aa  142  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000035223  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1853  GDSL family lipase  34.41 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211701 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2127  GDSL family lipase  34.47 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169473  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01055  hypothetical protein  38.86 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.411202  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3405  lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  34.58 
 
 		 244 aa  121  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4028  hypothetical protein  33.87 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012375 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1368  hypothetical protein  34.33 
 
 		 249 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1538  hypothetical protein  44.83 
 
 		 125 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.313345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15910  hypothetical protein  34.29 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.165827 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1537  hypothetical protein  53.09 
 
 		 82 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3985  GDSL family lipase  31.75 
 
 		 298 aa  65.5  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0334981  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  28.02 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0082  lipolytic protein G-D-S-L family  27.88 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  27.68 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00120  hypothetical protein  27.75 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0853  GDSL family lipase  27.06 
 
 		 361 aa  52  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1616  lipolytic protein G-D-S-L family  26.83 
 
 		 305 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0910  GDSL family lipase  26.94 
 
 		 361 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0909  GDSL family lipase  26.56 
 
 		 270 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  24.53 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2041  GDSL family lipase  26.79 
 
 		 320 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23917  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0437  putative secreted protein  27.2 
 
 		 347 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0852  GDSL family lipase  25.52 
 
 		 270 aa  45.8  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4676  GDSL family lipase  27.31 
 
 		 320 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.694492 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4226  GDSL family lipase  26.98 
 
 		 318 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.558892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  23.08 
 
 		 329 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4151  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.98 
 
 		 318 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11093  hypothetical protein  26.34 
 
 		 314 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.963411 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4382  GDSL family lipase  26.98 
 
 		 318 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4423  lipolytic protein G-D-S-L family  23.24 
 
 		 348 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5748  lipolytic protein G-D-S-L family  26.98 
 
 		 222 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  27.14 
 
 		 324 aa  42  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0930  lipolytic protein G-D-S-L family  24.39 
 
 		 340 aa  41.6  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>