100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1616 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1616  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 		 305 aa  610  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  62.46 
 
 		 305 aa  328  7e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2041  GDSL family lipase  55.79 
 
 		 320 aa  257  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23917  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4226  GDSL family lipase  54.42 
 
 		 318 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.558892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4151  lipolytic enzyme, G-D-S-L  54.42 
 
 		 318 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4382  GDSL family lipase  54.08 
 
 		 318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4676  GDSL family lipase  59.11 
 
 		 320 aa  248  8e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.694492 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11093  hypothetical protein  54.96 
 
 		 314 aa  243  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.963411 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  43.56 
 
 		 329 aa  179  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  44.35 
 
 		 343 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4423  lipolytic protein G-D-S-L family  45.53 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0853  GDSL family lipase  46.25 
 
 		 361 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0938  GDSL family lipase  42.34 
 
 		 348 aa  168  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0910  GDSL family lipase  45.83 
 
 		 361 aa  165  8e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  42.75 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0930  lipolytic protein G-D-S-L family  44.35 
 
 		 340 aa  163  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  39.57 
 
 		 368 aa  162  6e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0643  lipolytic protein G-D-S-L family  43.05 
 
 		 376 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0082  lipolytic protein G-D-S-L family  44.31 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3985  GDSL family lipase  44.53 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0334981  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0437  putative secreted protein  42.15 
 
 		 347 aa  142  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0909  GDSL family lipase  41.97 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0852  GDSL family lipase  39.58 
 
 		 270 aa  89.7  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3837  lipolytic protein G-D-S-L family  38.34 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.490417  normal  0.0238456 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2127  GDSL family lipase  29.9 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169473  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21100  lysophospholipase L1-like esterase  33.17 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2140  lipolytic protein G-D-S-L family  37.69 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  28.37 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3993  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3305  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0124  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  28.28 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3000  hypothetical protein  33.33 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3065  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3921  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.33 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619523  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0162  hypothetical protein  29.74 
 
 		 235 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  28.87 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  25.38 
 
 		 197 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3258  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  32.24 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2906  hypothetical protein  29.74 
 
 		 235 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0136  hypothetical protein  29.61 
 
 		 240 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0149  hypothetical protein  29.74 
 
 		 235 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  31.96 
 
 		 204 aa  53.5  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3261  hypothetical protein  27.46 
 
 		 250 aa  53.5  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  25.5 
 
 		 197 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  23.83 
 
 		 197 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0148  hypothetical protein  29.78 
 
 		 240 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  27.64 
 
 		 240 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  31.82 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0498  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.41 
 
 		 238 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4028  hypothetical protein  29.29 
 
 		 280 aa  50.8  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012375 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  25.5 
 
 		 211 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  25.5 
 
 		 197 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  32.41 
 
 		 201 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  25.5 
 
 		 197 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3328  hypothetical protein  29.65 
 
 		 235 aa  50.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  29.09 
 
 		 216 aa  50.1  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.82 
 
 		 270 aa  50.1  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  24.39 
 
 		 196 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  24.37 
 
 		 196 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  23.3 
 
 		 216 aa  49.7  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  25 
 
 		 211 aa  48.9  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2616  GDSL family lipase  28.5 
 
 		 225 aa  48.9  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2667  GDSL family lipase  31.77 
 
 		 234 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24646  hitchhiker  0.000175501 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2484  lipolytic protein G-D-S-L family  26.73 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1363  lipolytic protein G-D-S-L family  28.7 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3405  lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  26.21 
 
 		 244 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  33.33 
 
 		 201 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15910  hypothetical protein  30.15 
 
 		 249 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.165827 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  28.43 
 
 		 210 aa  47  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1326  GDSL family lipase  28.12 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0027  GDSL family lipase  29.63 
 
 		 255 aa  46.6  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2055  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  22.71 
 
 		 264 aa  45.8  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1368  hypothetical protein  27.84 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2954  lipolytic protein G-D-S-L family  27.6 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  27.44 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  30.25 
 
 		 210 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2866  hypothetical protein  26.15 
 
 		 242 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  27.93 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3142  hypothetical protein  25.26 
 
 		 237 aa  44.3  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.917118  normal  0.0747759 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  30.51 
 
 		 200 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2206  lipolytic enzyme, G-D-S-L  23.76 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0148894  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2242  Arylesterase  27.87 
 
 		 200 aa  43.9  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0186506  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  30.51 
 
 		 200 aa  43.5  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5194  GDSL family lipase  22.79 
 
 		 269 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1526  GDSL family lipase  23.83 
 
 		 206 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0224358  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5099  lipase/acylhydrolase  22.69 
 
 		 269 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  31.36 
 
 		 201 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1853  GDSL family lipase  25.26 
 
 		 263 aa  43.1  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  29.66 
 
 		 199 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5496  putative lipase/acylhydrolase  22.69 
 
 		 269 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2130  acyl-CoA thioesterase I  30.26 
 
 		 232 aa  42.7  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0925332  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5651  lipase/acylhydrolase  22.69 
 
 		 269 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5082  lipase/acylhydrolase  22.69 
 
 		 269 aa  42.7  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000543615  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5253  lipase/acylhydrolase  22.69 
 
 		 269 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1908  lipolytic enzyme, G-D-S-L  23.4 
 
 		 267 aa  42.7  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000035223  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.06 
 
 		 270 aa  42.7  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  29.66 
 
 		 201 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5524  putative lipase/acylhydrolase  22.69 
 
 		 269 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120317  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  27.86 
 
 		 261 aa  42.4  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>