74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0938 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0938  GDSL family lipase  100 
 
 		 348 aa  673    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0910  GDSL family lipase  55.28 
 
 		 361 aa  278  7e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0853  GDSL family lipase  54.93 
 
 		 361 aa  278  8e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0643  lipolytic protein G-D-S-L family  52.89 
 
 		 376 aa  271  8.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  52.01 
 
 		 329 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  54.37 
 
 		 343 aa  266  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  50.64 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0437  putative secreted protein  44.14 
 
 		 347 aa  220  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0082  lipolytic protein G-D-S-L family  47.23 
 
 		 351 aa  218  7.999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0930  lipolytic protein G-D-S-L family  53.99 
 
 		 340 aa  217  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  44.63 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3985  GDSL family lipase  46.31 
 
 		 298 aa  160  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0334981  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11093  hypothetical protein  42.68 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.963411 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4423  lipolytic protein G-D-S-L family  42.25 
 
 		 348 aa  158  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4151  lipolytic enzyme, G-D-S-L  45.27 
 
 		 318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4226  GDSL family lipase  45.27 
 
 		 318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.558892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2041  GDSL family lipase  44.03 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23917  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4382  GDSL family lipase  44.44 
 
 		 318 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1616  lipolytic protein G-D-S-L family  42.34 
 
 		 305 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4676  GDSL family lipase  43.48 
 
 		 320 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.694492 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  40.45 
 
 		 368 aa  143  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0909  GDSL family lipase  47.25 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0852  GDSL family lipase  46.33 
 
 		 270 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3837  lipolytic protein G-D-S-L family  40.1 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.490417  normal  0.0238456 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2140  lipolytic protein G-D-S-L family  37.19 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3405  lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  29.86 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  29 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  27.57 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.03 
 
 		 270 aa  52.8  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2127  GDSL family lipase  24.68 
 
 		 246 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169473  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  24.08 
 
 		 196 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2055  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  31.47 
 
 		 264 aa  49.7  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1853  GDSL family lipase  28.57 
 
 		 263 aa  49.7  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211701 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0162  hypothetical protein  34.78 
 
 		 235 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0149  hypothetical protein  35 
 
 		 235 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  23.56 
 
 		 211 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.57 
 
 		 226 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.2 
 
 		 270 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21100  lysophospholipase L1-like esterase  28.32 
 
 		 223 aa  48.5  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  23.04 
 
 		 196 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  34.58 
 
 		 210 aa  47  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  29.29 
 
 		 210 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  23.04 
 
 		 211 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.64 
 
 		 211 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2906  hypothetical protein  36.22 
 
 		 235 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  29.46 
 
 		 216 aa  47  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  23.04 
 
 		 197 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  23.04 
 
 		 197 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3258  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  31.21 
 
 		 258 aa  46.2  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  26.57 
 
 		 226 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  29.13 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0068  lipolytic protein  30.18 
 
 		 247 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523857  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.83 
 
 		 204 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3328  hypothetical protein  35 
 
 		 235 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  27.94 
 
 		 202 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  23.65 
 
 		 241 aa  44.3  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0124  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  30.23 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3305  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  30.28 
 
 		 244 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  23.65 
 
 		 241 aa  44.3  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3142  hypothetical protein  25.26 
 
 		 237 aa  44.3  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.917118  normal  0.0747759 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2866  hypothetical protein  26.03 
 
 		 242 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3921  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.28 
 
 		 244 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3993  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.28 
 
 		 244 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3065  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  30.28 
 
 		 244 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  27.07 
 
 		 239 aa  43.9  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3000  hypothetical protein  30.23 
 
 		 267 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  28.68 
 
 		 216 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  23.04 
 
 		 197 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  30.66 
 
 		 249 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0136  hypothetical protein  30.85 
 
 		 240 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  26.85 
 
 		 266 aa  43.1  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  23.76 
 
 		 223 aa  42.7  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  29.51 
 
 		 214 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0086  lipolytic protein G-D-S-L family  29.52 
 
 		 240 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>