71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0852 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0852  GDSL family lipase  100 
 
 
270 aa  508  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0909  GDSL family lipase  87.41 
 
 
270 aa  393  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  49.75 
 
 
329 aa  152  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0938  GDSL family lipase  46.19 
 
 
348 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0643  lipolytic protein G-D-S-L family  47.5 
 
 
376 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  46.12 
 
 
324 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0930  lipolytic protein G-D-S-L family  48.28 
 
 
340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0910  GDSL family lipase  50.25 
 
 
361 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0853  GDSL family lipase  50.52 
 
 
361 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3985  GDSL family lipase  42.21 
 
 
298 aa  125  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0334981  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  44.67 
 
 
343 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  40.98 
 
 
305 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0082  lipolytic protein G-D-S-L family  40.5 
 
 
351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  38.78 
 
 
368 aa  112  6e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4382  GDSL family lipase  39.13 
 
 
318 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4423  lipolytic protein G-D-S-L family  37.23 
 
 
348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4151  lipolytic enzyme, G-D-S-L  39.13 
 
 
318 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4226  GDSL family lipase  39.13 
 
 
318 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.558892  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11093  hypothetical protein  41.9 
 
 
314 aa  102  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.963411 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2041  GDSL family lipase  42.13 
 
 
320 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23917  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1616  lipolytic protein G-D-S-L family  40.1 
 
 
305 aa  97.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0437  putative secreted protein  38.19 
 
 
347 aa  97.1  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4676  GDSL family lipase  41.62 
 
 
320 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.694492 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3837  lipolytic protein G-D-S-L family  42 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.490417  normal  0.0238456 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1853  GDSL family lipase  29.59 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211701 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  33.73 
 
 
244 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3405  lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  32.99 
 
 
244 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2140  lipolytic protein G-D-S-L family  38.78 
 
 
207 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2127  GDSL family lipase  28.02 
 
 
246 aa  59.7  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169473  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0068  lipolytic protein  36.02 
 
 
247 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523857  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15910  hypothetical protein  28.21 
 
 
249 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.165827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1368  hypothetical protein  30.26 
 
 
249 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0498  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.42 
 
 
238 aa  56.6  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2616  GDSL family lipase  29.96 
 
 
225 aa  56.6  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01055  hypothetical protein  28.04 
 
 
217 aa  56.2  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.411202  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3142  hypothetical protein  29.53 
 
 
237 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.917118  normal  0.0747759 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  36.76 
 
 
249 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0086  lipolytic protein G-D-S-L family  34.76 
 
 
240 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3261  hypothetical protein  24.77 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  23.44 
 
 
220 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0148  hypothetical protein  32.06 
 
 
240 aa  52.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2906  hypothetical protein  32.63 
 
 
235 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0162  hypothetical protein  32.29 
 
 
235 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0136  hypothetical protein  32.06 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.95 
 
 
183 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0149  hypothetical protein  32.29 
 
 
235 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3000  hypothetical protein  33.01 
 
 
267 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0124  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  33.01 
 
 
267 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3921  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.01 
 
 
244 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619523  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3065  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  33.01 
 
 
244 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2055  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  27.82 
 
 
264 aa  50.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  24.41 
 
 
225 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3993  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.52 
 
 
244 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3305  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  32.52 
 
 
244 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1908  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.78 
 
 
267 aa  48.9  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000035223  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  34.71 
 
 
210 aa  47.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21100  lysophospholipase L1-like esterase  29.61 
 
 
223 aa  48.1  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1259  lipolytic protein G-D-S-L family  27.64 
 
 
725 aa  47  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.437163  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3258  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  31.78 
 
 
258 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.93 
 
 
270 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  29.65 
 
 
219 aa  46.6  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  25.24 
 
 
216 aa  45.8  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  33.93 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3328  hypothetical protein  32.26 
 
 
235 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0436  GDSL family lipase  25.27 
 
 
208 aa  44.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.633376  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  30.06 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0143  lipolytic protein G-D-S-L family  26.23 
 
 
305 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2866  hypothetical protein  23.15 
 
 
242 aa  42.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2206  lipolytic enzyme, G-D-S-L  23.47 
 
 
280 aa  42  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0148894  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3393  lipolytic protein G-D-S-L family  29.63 
 
 
209 aa  42  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0644196  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  27.64 
 
 
269 aa  42  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>