68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2616 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2616  GDSL family lipase  100 
 
 		 225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2866  hypothetical protein  42.11 
 
 		 242 aa  169  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3000  hypothetical protein  47.72 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0124  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  47.72 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3065  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  47.72 
 
 		 244 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3993  lipolytic enzyme, G-D-S-L  47.72 
 
 		 244 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3921  lipolytic enzyme, G-D-S-L  47.72 
 
 		 244 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619523  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3305  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  47.21 
 
 		 244 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3261  hypothetical protein  41.07 
 
 		 250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0498  lipolytic enzyme, G-D-S-L  39.19 
 
 		 238 aa  160  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3258  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  46.19 
 
 		 258 aa  157  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3142  hypothetical protein  44.91 
 
 		 237 aa  155  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.917118  normal  0.0747759 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2055  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  39.58 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0148  hypothetical protein  42.93 
 
 		 240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0162  hypothetical protein  42.42 
 
 		 235 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0136  hypothetical protein  42.93 
 
 		 240 aa  144  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0149  hypothetical protein  42.42 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2906  hypothetical protein  41.92 
 
 		 235 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3328  hypothetical protein  42.13 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1908  lipolytic enzyme, G-D-S-L  38.02 
 
 		 267 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000035223  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1853  GDSL family lipase  33.05 
 
 		 263 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211701 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2206  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.71 
 
 		 280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0148894  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01055  hypothetical protein  34.76 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.411202  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1915  hypothetical protein  29.67 
 
 		 280 aa  100  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000228464  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3405  lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  33.96 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1368  hypothetical protein  34.83 
 
 		 249 aa  89  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15910  hypothetical protein  36 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.165827 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2127  GDSL family lipase  31.44 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169473  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4028  hypothetical protein  32.27 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012375 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1537  hypothetical protein  60.61 
 
 		 82 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1538  hypothetical protein  45.35 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.313345  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4478  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.4 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  29.49 
 
 		 305 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  26.47 
 
 		 368 aa  55.8  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0909  GDSL family lipase  32.64 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4423  lipolytic protein G-D-S-L family  29.35 
 
 		 348 aa  52  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5748  lipolytic protein G-D-S-L family  30.81 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1034  Sialate O-acetylesterase  24.39 
 
 		 689 aa  49.3  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3985  GDSL family lipase  29.19 
 
 		 298 aa  49.3  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0334981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0643  lipolytic protein G-D-S-L family  28.88 
 
 		 376 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4676  GDSL family lipase  30.89 
 
 		 320 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.694492 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0852  GDSL family lipase  29.9 
 
 		 270 aa  48.5  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  24.89 
 
 		 250 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1616  lipolytic protein G-D-S-L family  28.86 
 
 		 305 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3444  arylesterase  29.31 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000206648 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0068  lipolytic protein  31.5 
 
 		 247 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523857  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0930  lipolytic protein G-D-S-L family  29.21 
 
 		 340 aa  46.2  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1032  lysophospholipase  25.98 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  26.73 
 
 		 329 aa  45.4  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2368  arylesterase  28.42 
 
 		 188 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  28.69 
 
 		 374 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  28.65 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4151  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.52 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  28.28 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0086  lipolytic protein G-D-S-L family  28.28 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0938  GDSL family lipase  28.85 
 
 		 348 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2898  arylesterase  27.37 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179811  hitchhiker  0.000609296 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4226  GDSL family lipase  29.52 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.558892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  26.67 
 
 		 252 aa  43.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2041  GDSL family lipase  28.95 
 
 		 320 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23917  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  27.04 
 
 		 219 aa  42.4  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3163  lipolytic protein G-D-S-L family  30.28 
 
 		 241 aa  42.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  26.77 
 
 		 343 aa  42.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1589  lipolytic protein G-D-S-L family  23.67 
 
 		 264 aa  42.4  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0691726  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4382  GDSL family lipase  29.07 
 
 		 318 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2392  arylesterase  30.11 
 
 		 199 aa  42.4  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1258  G-D-S-L family lipolytic protein  24.72 
 
 		 274 aa  42  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  29.89 
 
 		 233 aa  41.6  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>