166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2189 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  100 
 
 		 250 aa  514  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2227  lipolytic protein G-D-S-L family  62.01 
 
 		 285 aa  286  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0951  hypothetical protein  39.51 
 
 		 327 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0988  hypothetical protein  39.51 
 
 		 328 aa  172  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2374  hypothetical protein  42.27 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  hitchhiker  0.00086593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0929  hypothetical protein  39.27 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5410  hypothetical protein  38.91 
 
 		 288 aa  158  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5560  hypothetical protein  37.1 
 
 		 289 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.75 
 
 		 329 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.95 
 
 		 327 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  34.33 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  34.33 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  30.73 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  32.21 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  35.41 
 
 		 327 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.12 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  33.49 
 
 		 277 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  33.66 
 
 		 322 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  34.08 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  34.93 
 
 		 379 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  32.7 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  31.58 
 
 		 267 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  31.1 
 
 		 267 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  31.1 
 
 		 267 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  30.54 
 
 		 238 aa  89  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0766  hypothetical protein  29.94 
 
 		 252 aa  85.9  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0644448  hitchhiker  0.00367044 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1136  lipolytic protein G-D-S-L family  27.83 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.527097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0221  hypothetical protein  31.64 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5253  hypothetical protein  30.6 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.209286  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0789  hypothetical protein  31.28 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161897  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0137  hypothetical protein  29.29 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3748  GDSL family lipase  31.86 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4911  hypothetical protein  29.67 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.797649 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  30.46 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2989  GDSL family lipase  27.36 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.816827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  37.07 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  34.07 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.33 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  31.85 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0900  hypothetical protein  32.67 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  25.65 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  27.89 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  27.23 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1526  GDSL family lipase  25.98 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0224358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  28.07 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2112  lipolytic protein G-D-S-L family  25.49 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.835545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  29.32 
 
 		 201 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0488  GDSL family lipase  33.59 
 
 		 203 aa  57  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  26.26 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  25.13 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  25.73 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1745  GDSL family lipase  28.64 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0864047  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2630  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.66 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0895129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  27.12 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3205  GDSL family lipase  25 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765552  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  28.28 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  30.89 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  24.19 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  28 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  26.29 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  25.97 
 
 		 216 aa  54.7  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  28.83 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3558  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.7 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0285978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.6 
 
 		 211 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  28.89 
 
 		 195 aa  52.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  23.08 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  27.56 
 
 		 214 aa  52  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  29.6 
 
 		 202 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  29.84 
 
 		 201 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  27.5 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  24.75 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  24.61 
 
 		 195 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1152  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  28.57 
 
 		 199 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  24.75 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2149  putative lipase  26.35 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.208079 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  30 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3734  GDSL family lipase  24.49 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00414819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  30 
 
 		 240 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  24.06 
 
 		 201 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  28.47 
 
 		 202 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  23.86 
 
 		 200 aa  50.4  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  28.57 
 
 		 201 aa  50.4  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1912  Arylesterase  32.63 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2289  arylesterase  33.68 
 
 		 208 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85039  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4411  lipolytic protein G-D-S-L family  25 
 
 		 228 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  25.53 
 
 		 216 aa  50.4  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  27.56 
 
 		 210 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  27.07 
 
 		 201 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0725  lipolytic protein G-D-S-L family  25.54 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0548  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.18 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.386484  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  28.17 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.27 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  29.51 
 
 		 205 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  28.15 
 
 		 201 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  27.07 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  29.37 
 
 		 248 aa  49.7  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  30.07 
 
 		 240 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  23.86 
 
 		 200 aa  49.3  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  24.87 
 
 		 214 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>