118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3748 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3748  GDSL family lipase  100 
 
 
300 aa  587  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  39.9 
 
 
318 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  36.7 
 
 
322 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  38.46 
 
 
303 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.19 
 
 
329 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.8 
 
 
327 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  35.1 
 
 
379 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  34.03 
 
 
327 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  37.11 
 
 
267 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  37.11 
 
 
267 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  36.67 
 
 
267 aa  106  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  37.19 
 
 
238 aa  105  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  33.08 
 
 
286 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  36.57 
 
 
275 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  36.14 
 
 
275 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  32.51 
 
 
269 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  31.86 
 
 
250 aa  95.9  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2374  hypothetical protein  33.18 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  hitchhiker  0.00086593 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  38.18 
 
 
277 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  35.64 
 
 
279 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0951  hypothetical protein  31.68 
 
 
327 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0988  hypothetical protein  29.86 
 
 
328 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2227  lipolytic protein G-D-S-L family  36.98 
 
 
285 aa  85.9  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5410  hypothetical protein  29.67 
 
 
288 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465683  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0929  hypothetical protein  31.66 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1136  lipolytic protein G-D-S-L family  33.49 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.527097  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0766  hypothetical protein  32.77 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0644448  hitchhiker  0.00367044 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  28.37 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4911  hypothetical protein  31.06 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.797649 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.51 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  30.73 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5560  hypothetical protein  27.27 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  31.05 
 
 
223 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  29.73 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0137  hypothetical protein  25.78 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  33.16 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0900  hypothetical protein  29.61 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0221  hypothetical protein  31.03 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5253  hypothetical protein  34.12 
 
 
259 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.209286  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0789  hypothetical protein  30.19 
 
 
259 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161897  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  28.7 
 
 
204 aa  63.5  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  33.33 
 
 
213 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  30.3 
 
 
210 aa  60.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  31.09 
 
 
255 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  37.37 
 
 
204 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2630  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.75 
 
 
198 aa  56.2  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0895129  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  26.83 
 
 
368 aa  56.2  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  31.08 
 
 
201 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  30.25 
 
 
202 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.97 
 
 
211 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  26.5 
 
 
239 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  26.98 
 
 
216 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  38.68 
 
 
240 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  32.89 
 
 
251 aa  52.4  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  27.6 
 
 
219 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2127  GDSL family lipase  29.47 
 
 
246 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169473  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2928  acyl-CoA thioesterase I, putative  27.92 
 
 
227 aa  50.8  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  27.32 
 
 
241 aa  50.4  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  27.32 
 
 
241 aa  50.1  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  27.7 
 
 
218 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  30.43 
 
 
210 aa  49.7  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2914  arylesterase  28.57 
 
 
212 aa  49.3  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  27.22 
 
 
195 aa  48.9  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.14 
 
 
225 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1478  arylesterase  28.43 
 
 
199 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1543  arylesterase  28.43 
 
 
199 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1537  GDSL family lipase  28.43 
 
 
199 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131898 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3602  hypothetical protein  28.5 
 
 
685 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  26.7 
 
 
216 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  29.9 
 
 
213 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  26.7 
 
 
216 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4506  lipolytic protein G-D-S-L family  24.09 
 
 
230 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  33.94 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0561  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  27.23 
 
 
204 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.868884  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0615  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  27.23 
 
 
204 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.382556  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0571  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  27.23 
 
 
204 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0554  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  27.23 
 
 
204 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0556  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  27.23 
 
 
204 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  24.09 
 
 
230 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  29.73 
 
 
205 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2141  GDSL family lipase  27.6 
 
 
192 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.336589  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.16 
 
 
204 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3205  GDSL family lipase  39.51 
 
 
201 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765552  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  29.74 
 
 
233 aa  47  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  29.41 
 
 
208 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  31.36 
 
 
255 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  29.41 
 
 
208 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.26 
 
 
226 aa  46.2  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1485  arylesterase  28.85 
 
 
195 aa  46.2  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  33.91 
 
 
201 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  28.72 
 
 
214 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2688  arylesterase  27.41 
 
 
199 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  36.54 
 
 
257 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1678  Arylesterase  27.41 
 
 
185 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740826  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0731  lipolytic protein G-D-S-L family  26.16 
 
 
265 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1401  arylesterase  29.65 
 
 
226 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4796  lipolytic protein  25.12 
 
 
239 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1152  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.76 
 
 
227 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2616  GDSL family lipase  26.92 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2709  arylesterase  27.92 
 
 
216 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>