59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0929 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0929  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  545  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0988  hypothetical protein  91.97 
 
 		 328 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0951  hypothetical protein  91.6 
 
 		 327 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5410  hypothetical protein  63.52 
 
 		 288 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2374  hypothetical protein  59.09 
 
 		 276 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  hitchhiker  0.00086593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5560  hypothetical protein  58.85 
 
 		 289 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  39.27 
 
 		 250 aa  166  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2227  lipolytic protein G-D-S-L family  40.91 
 
 		 285 aa  149  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  28.57 
 
 		 322 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5253  hypothetical protein  34.44 
 
 		 259 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.209286  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0766  hypothetical protein  30.98 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0644448  hitchhiker  0.00367044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4911  hypothetical protein  33.52 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.797649 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0137  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0789  hypothetical protein  33.51 
 
 		 259 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161897  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.46 
 
 		 327 aa  92.4  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.57 
 
 		 329 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  29.02 
 
 		 327 aa  89  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0221  hypothetical protein  33.15 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  32.26 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0900  hypothetical protein  35.68 
 
 		 259 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  32.26 
 
 		 275 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  31.05 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  26.79 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  30.77 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  30.32 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.34 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  31.55 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  31.55 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  30.1 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  33.33 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  26.72 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1136  lipolytic protein G-D-S-L family  26.6 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.527097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  33.1 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  30.92 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3748  GDSL family lipase  28.64 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  37.27 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  27.7 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  30.61 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.61 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  26.06 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  37.07 
 
 		 213 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  32.17 
 
 		 209 aa  48.9  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  27.21 
 
 		 204 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3412  arylesterase  28.37 
 
 		 182 aa  48.5  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.634502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  28.92 
 
 		 226 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  33.64 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  26.42 
 
 		 201 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.22 
 
 		 204 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  32.22 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.72 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  30.5 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4035  arylesterase  27.56 
 
 		 214 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926755 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  29.53 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  32.11 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  26.21 
 
 		 241 aa  43.9  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  26.21 
 
 		 241 aa  43.9  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2928  acyl-CoA thioesterase I, putative  29.45 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  33.64 
 
 		 189 aa  43.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2112  lipolytic protein G-D-S-L family  29.8 
 
 		 218 aa  43.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.835545 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>