113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0901 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  100 
 
 		 303 aa  617  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  84.33 
 
 		 318 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  73.51 
 
 		 322 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  73.77 
 
 		 329 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  69.06 
 
 		 379 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  62.75 
 
 		 327 aa  394  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  61.3 
 
 		 327 aa  362  3e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  42.16 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  42.16 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  39.23 
 
 		 269 aa  144  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  42.93 
 
 		 238 aa  142  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  42.23 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  44.29 
 
 		 279 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  42.23 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  40.39 
 
 		 267 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  40.39 
 
 		 267 aa  124  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  38.81 
 
 		 267 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  35.12 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2227  lipolytic protein G-D-S-L family  35.07 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4911  hypothetical protein  32.09 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.797649 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1136  lipolytic protein G-D-S-L family  32.04 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.527097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0766  hypothetical protein  31.68 
 
 		 252 aa  99  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0644448  hitchhiker  0.00367044 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3748  GDSL family lipase  38.46 
 
 		 300 aa  99  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5253  hypothetical protein  30.28 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.209286  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0789  hypothetical protein  31.94 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161897  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0988  hypothetical protein  26.51 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0951  hypothetical protein  26.75 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0221  hypothetical protein  30.2 
 
 		 253 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0900  hypothetical protein  31.21 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5560  hypothetical protein  30.68 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5410  hypothetical protein  27.9 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0137  hypothetical protein  27.8 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2374  hypothetical protein  25.68 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  hitchhiker  0.00086593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0929  hypothetical protein  26.44 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  30.56 
 
 		 204 aa  65.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2630  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.75 
 
 		 198 aa  61.6  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0895129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  28.5 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  28.06 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.51 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.57 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  29.15 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2989  GDSL family lipase  31.32 
 
 		 203 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.816827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  29.67 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2149  putative lipase  36.7 
 
 		 203 aa  54.3  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.208079 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  28.18 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  30 
 
 		 201 aa  53.5  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  27.55 
 
 		 223 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  29.44 
 
 		 240 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  26.5 
 
 		 220 aa  52.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  34.55 
 
 		 202 aa  52.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  29.82 
 
 		 213 aa  52.8  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  32.84 
 
 		 255 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  34.21 
 
 		 240 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  27.5 
 
 		 219 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3734  GDSL family lipase  36.46 
 
 		 207 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00414819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  30.2 
 
 		 215 aa  50.4  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  35.14 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  27.88 
 
 		 216 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2409  arylesterase  31.5 
 
 		 204 aa  50.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170275 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  30.41 
 
 		 209 aa  50.1  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  27.59 
 
 		 225 aa  50.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  29.93 
 
 		 202 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  29.93 
 
 		 205 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  33.63 
 
 		 201 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3602  hypothetical protein  23.76 
 
 		 685 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1745  GDSL family lipase  33.03 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0864047  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  28.57 
 
 		 241 aa  48.1  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  31.93 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0686  acyl-CoA thioesterase I precursor  25.87 
 
 		 206 aa  48.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4377  putative lipase  27.81 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  28.57 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  30.41 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  30 
 
 		 214 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3591  hypothetical protein  28.36 
 
 		 451 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0183177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  26.98 
 
 		 200 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3870  putative lipase  24.1 
 
 		 239 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.749883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2141  GDSL family lipase  23.71 
 
 		 189 aa  47  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.953926  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3558  lipolytic enzyme, G-D-S-L  36.11 
 
 		 201 aa  47  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0285978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  29.09 
 
 		 202 aa  46.6  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  37.5 
 
 		 234 aa  46.6  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1104  platelet activating factor, putative  27.71 
 
 		 204 aa  46.2  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  33.94 
 
 		 189 aa  46.2  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.92 
 
 		 228 aa  46.2  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  28.48 
 
 		 195 aa  46.2  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  30.67 
 
 		 255 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  29.58 
 
 		 205 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  25.29 
 
 		 201 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0488  GDSL family lipase  27.84 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1015  lysophospholipase L1 or related esterase  28.16 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  30.07 
 
 		 201 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1523  lipolytic protein G-D-S-L family  30.77 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0285  arylesterase precursor  25.33 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1152  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.71 
 
 		 227 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  24.53 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3443  esterase  27.32 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0553  lipolytic protein G-D-S-L family  34.92 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  25.98 
 
 		 244 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  26.98 
 
 		 200 aa  44.3  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  30.43 
 
 		 201 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  31.34 
 
 		 216 aa  43.5  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>