90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1996 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  100 
 
 
238 aa  472  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  44.39 
 
 
329 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  43.75 
 
 
379 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  44.88 
 
 
318 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  42.93 
 
 
303 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  42.29 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  40.98 
 
 
322 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  40.49 
 
 
327 aa  137  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  39.37 
 
 
267 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  39.37 
 
 
267 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  42.36 
 
 
286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  42.36 
 
 
275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  39.02 
 
 
327 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  38.65 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  41.38 
 
 
275 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  42.65 
 
 
279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  40.89 
 
 
277 aa  105  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2227  lipolytic protein G-D-S-L family  33.99 
 
 
285 aa  97.1  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  30.14 
 
 
250 aa  90.5  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4911  hypothetical protein  31.3 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.797649 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0766  hypothetical protein  32.35 
 
 
252 aa  88.6  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0644448  hitchhiker  0.00367044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0951  hypothetical protein  31.13 
 
 
327 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0988  hypothetical protein  31.13 
 
 
328 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3748  GDSL family lipase  36.09 
 
 
300 aa  79  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5253  hypothetical protein  31.08 
 
 
259 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.209286  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0221  hypothetical protein  30.65 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1136  lipolytic protein G-D-S-L family  30 
 
 
221 aa  77  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.527097  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2374  hypothetical protein  29.41 
 
 
276 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  hitchhiker  0.00086593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0929  hypothetical protein  30.19 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0789  hypothetical protein  30.1 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161897  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0900  hypothetical protein  30.11 
 
 
259 aa  68.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0137  hypothetical protein  27.5 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5410  hypothetical protein  27.6 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465683  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5560  hypothetical protein  27.22 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  28.57 
 
 
223 aa  63.2  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  28.42 
 
 
223 aa  62.4  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  27.84 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  27.84 
 
 
241 aa  57  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  27.49 
 
 
239 aa  55.1  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3393  lipolytic protein G-D-S-L family  31.67 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0644196  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.15 
 
 
270 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.28 
 
 
183 aa  52.8  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3870  putative lipase  27.11 
 
 
239 aa  52.4  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.749883  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  31.05 
 
 
270 aa  52  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  35.71 
 
 
201 aa  52  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.03 
 
 
204 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  30.67 
 
 
204 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  29.32 
 
 
219 aa  48.9  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  29.33 
 
 
251 aa  48.9  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3205  GDSL family lipase  27.27 
 
 
201 aa  48.9  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765552  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0443  GDSL family lipase  34.12 
 
 
213 aa  48.5  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.665716  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.7 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  27.56 
 
 
210 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  32.65 
 
 
240 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2630  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.55 
 
 
198 aa  46.6  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0895129  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2077  lipolytic protein G-D-S-L family  31.37 
 
 
241 aa  47  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4377  putative lipase  28.12 
 
 
238 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  24.86 
 
 
213 aa  46.6  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  29.03 
 
 
201 aa  46.2  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0548  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.54 
 
 
227 aa  45.8  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.386484  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  33.33 
 
 
266 aa  45.4  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  28.69 
 
 
209 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  29.33 
 
 
202 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  30.6 
 
 
202 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  25.26 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  29.95 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2141  GDSL family lipase  24.12 
 
 
189 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.953926  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  24.59 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  31.29 
 
 
261 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  28.26 
 
 
200 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0817  lipolytic protein G-D-S-L family  30.61 
 
 
331 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00788434 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  27.91 
 
 
447 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2989  GDSL family lipase  29.79 
 
 
203 aa  43.5  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.816827  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  23.71 
 
 
195 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0488  GDSL family lipase  30.05 
 
 
203 aa  43.5  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307636  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0285  arylesterase precursor  28.42 
 
 
206 aa  43.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19520  lysophospholipase L1-like esterase  31.07 
 
 
209 aa  43.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.347124  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0553  lipolytic protein G-D-S-L family  30 
 
 
214 aa  43.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0355  hypothetical protein  26.32 
 
 
248 aa  42.7  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  22.29 
 
 
215 aa  42  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  31.08 
 
 
255 aa  42.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3116  Lysophospholipase  24.84 
 
 
197 aa  42  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3122  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  24.84 
 
 
197 aa  42  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1921  lipolytic protein G-D-S-L family  29.24 
 
 
198 aa  42  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1745  GDSL family lipase  35.8 
 
 
242 aa  42  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0864047  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00450  hypothetical protein  23.73 
 
 
208 aa  41.6  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0429  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  24.84 
 
 
207 aa  41.6  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0543  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  24.84 
 
 
207 aa  41.6  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0574  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  24.84 
 
 
207 aa  41.6  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00445  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  23.73 
 
 
208 aa  41.6  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>