119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0220 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  100 
 
 		 327 aa  665    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  81.88 
 
 		 327 aa  481  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  61.85 
 
 		 329 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  68.44 
 
 		 303 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  67.68 
 
 		 322 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  61.41 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  63.88 
 
 		 318 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  41.35 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  41.35 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  41.35 
 
 		 275 aa  153  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  42.47 
 
 		 279 aa  146  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  37.56 
 
 		 269 aa  139  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  40.49 
 
 		 238 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  40.49 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  35.71 
 
 		 267 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  35.71 
 
 		 267 aa  127  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  34.82 
 
 		 267 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  34.95 
 
 		 250 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2227  lipolytic protein G-D-S-L family  36.41 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4911  hypothetical protein  31.19 
 
 		 254 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.797649 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2374  hypothetical protein  31.22 
 
 		 276 aa  102  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  hitchhiker  0.00086593 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1136  lipolytic protein G-D-S-L family  32.99 
 
 		 221 aa  96.3  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.527097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5253  hypothetical protein  29.09 
 
 		 259 aa  95.9  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.209286  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0766  hypothetical protein  28.64 
 
 		 252 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0644448  hitchhiker  0.00367044 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0988  hypothetical protein  30.29 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0951  hypothetical protein  30.29 
 
 		 327 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5560  hypothetical protein  33.33 
 
 		 289 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3748  GDSL family lipase  34.8 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5410  hypothetical protein  29.79 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0929  hypothetical protein  29.46 
 
 		 270 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0789  hypothetical protein  29.03 
 
 		 259 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161897  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0137  hypothetical protein  28.63 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0900  hypothetical protein  27.98 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0221  hypothetical protein  28.64 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  30.1 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  29.79 
 
 		 204 aa  65.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  29.17 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  29.05 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  28.92 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.38 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2630  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.3 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0895129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1523  lipolytic protein G-D-S-L family  30.43 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2149  putative lipase  31.89 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.208079 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.92 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3870  putative lipase  27.85 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.749883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1745  GDSL family lipase  30.22 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0864047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  35.78 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  33.33 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  30.81 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  34.26 
 
 		 216 aa  55.5  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  34.86 
 
 		 204 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  30.92 
 
 		 240 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  28.65 
 
 		 213 aa  53.9  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  25.49 
 
 		 255 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  32.77 
 
 		 201 aa  53.5  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  25 
 
 		 239 aa  53.1  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  27.5 
 
 		 219 aa  52.8  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2989  GDSL family lipase  30.26 
 
 		 203 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.816827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  31.93 
 
 		 210 aa  51.6  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  25.52 
 
 		 200 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  27.69 
 
 		 214 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4377  putative lipase  33.02 
 
 		 238 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  27.34 
 
 		 225 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  32.08 
 
 		 209 aa  50.4  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  30.41 
 
 		 240 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1829  esterase  27.04 
 
 		 188 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0305538  normal  0.13667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3734  GDSL family lipase  38.54 
 
 		 207 aa  49.3  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00414819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  30.41 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  31.72 
 
 		 202 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0553  lipolytic protein G-D-S-L family  38.1 
 
 		 214 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  24.14 
 
 		 200 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  26.39 
 
 		 252 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  35.71 
 
 		 201 aa  48.5  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  25 
 
 		 219 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  29.66 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  24.38 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  27.36 
 
 		 447 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3118  esterase  25.13 
 
 		 188 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2409  arylesterase  30.16 
 
 		 204 aa  47.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170275 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.39 
 
 		 204 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1015  lysophospholipase L1 or related esterase  27.88 
 
 		 299 aa  47.4  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  26.67 
 
 		 233 aa  47.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  33.03 
 
 		 189 aa  47  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  25 
 
 		 195 aa  47  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  25.83 
 
 		 210 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0285  arylesterase precursor  24.86 
 
 		 206 aa  47  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  23.67 
 
 		 215 aa  46.6  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3416  esterase  26.7 
 
 		 188 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0484902  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3273  hypothetical protein  23.5 
 
 		 260 aa  46.2  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000574535  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2141  GDSL family lipase  25.26 
 
 		 189 aa  46.2  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.953926  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  29.82 
 
 		 216 aa  46.2  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0686  acyl-CoA thioesterase I precursor  25.87 
 
 		 206 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3205  GDSL family lipase  25.97 
 
 		 201 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765552  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2070  lipolytic protein G-D-S-L family  30.77 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.397214  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3427  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  25.52 
 
 		 188 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.33 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  28.38 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  27.74 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  32.26 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  25.26 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>