123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2227 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2227  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 		 285 aa  583  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  62.23 
 
 		 250 aa  307  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5410  hypothetical protein  41.41 
 
 		 288 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5560  hypothetical protein  41.43 
 
 		 289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0988  hypothetical protein  42.27 
 
 		 328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0951  hypothetical protein  42.27 
 
 		 327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2374  hypothetical protein  40.72 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  hitchhiker  0.00086593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0929  hypothetical protein  42.27 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  36.71 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  35.92 
 
 		 322 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  33.49 
 
 		 269 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.43 
 
 		 329 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  34.02 
 
 		 267 aa  122  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  35.82 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  35.82 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  34.55 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  34.55 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  34.91 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.07 
 
 		 303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  34.13 
 
 		 275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  34.3 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  35.07 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  36.45 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  33.66 
 
 		 238 aa  109  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  35.61 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5253  hypothetical protein  32.97 
 
 		 259 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.209286  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0789  hypothetical protein  31.11 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161897  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1136  lipolytic protein G-D-S-L family  30.19 
 
 		 221 aa  94.7  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.527097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0766  hypothetical protein  29.73 
 
 		 252 aa  86.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0644448  hitchhiker  0.00367044 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0221  hypothetical protein  33.52 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3748  GDSL family lipase  36.6 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4911  hypothetical protein  28.37 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.797649 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  29.67 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0900  hypothetical protein  28.57 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.5 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0137  hypothetical protein  29.21 
 
 		 253 aa  72  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  31.38 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  29.03 
 
 		 213 aa  65.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  29.21 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  35.08 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3205  GDSL family lipase  28.19 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765552  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2112  lipolytic protein G-D-S-L family  28.5 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.835545 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2989  GDSL family lipase  29.51 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.816827  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  29.44 
 
 		 219 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  29.9 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2149  putative lipase  29.57 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.208079 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1401  arylesterase  23.08 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  27.72 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  29.05 
 
 		 214 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  27.84 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0488  GDSL family lipase  30.48 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  25 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  30.18 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  27.72 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  28.95 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  25.4 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  26.78 
 
 		 202 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  27.81 
 
 		 214 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  26.18 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2630  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.23 
 
 		 198 aa  53.5  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0895129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2368  arylesterase  26.01 
 
 		 188 aa  53.1  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1745  GDSL family lipase  26.09 
 
 		 242 aa  53.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0864047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  26.04 
 
 		 201 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  26.15 
 
 		 201 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1599  lipolytic protein G-D-S-L family  25.4 
 
 		 222 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  26.88 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.13 
 
 		 226 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1526  GDSL family lipase  24.46 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0224358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  26.02 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1278  GDSL family lipase  31.37 
 
 		 223 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398687  normal  0.0389661 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  28.26 
 
 		 251 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6500  lipolytic protein G-D-S-L family  27.37 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  28.06 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  26.46 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.84 
 
 		 228 aa  49.7  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4411  lipolytic protein G-D-S-L family  24.35 
 
 		 228 aa  50.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  26.63 
 
 		 201 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  28.21 
 
 		 255 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  26.57 
 
 		 252 aa  49.3  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0010  Arylesterase  27.56 
 
 		 228 aa  48.9  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.939172  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0686  acyl-CoA thioesterase I precursor  25.27 
 
 		 206 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  26.63 
 
 		 201 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3734  GDSL family lipase  25.13 
 
 		 207 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00414819  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  29.79 
 
 		 241 aa  48.1  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1250  arylesterase  25.76 
 
 		 208 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2959  arylesterase  23.37 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  29.79 
 
 		 241 aa  48.1  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  24.59 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0143  lipolytic protein G-D-S-L family  26.56 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  28.57 
 
 		 240 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  25.27 
 
 		 216 aa  46.2  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  24.17 
 
 		 219 aa  46.2  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0650  GDSL family lipase  21.71 
 
 		 219 aa  46.2  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2263  hypothetical protein  25 
 
 		 371 aa  46.2  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  24 
 
 		 215 aa  46.2  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3558  lipolytic enzyme, G-D-S-L  23.94 
 
 		 201 aa  45.8  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0285978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  26.04 
 
 		 199 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  24.18 
 
 		 210 aa  45.8  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  25.13 
 
 		 201 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  29.13 
 
 		 201 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>