82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5410 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5410  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465683  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5560  hypothetical protein  83.21 
 
 
289 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0951  hypothetical protein  59.7 
 
 
327 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0988  hypothetical protein  62.76 
 
 
328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0929  hypothetical protein  65.32 
 
 
270 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2374  hypothetical protein  57.08 
 
 
276 aa  249  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  hitchhiker  0.00086593 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  38.91 
 
 
250 aa  158  9e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2227  lipolytic protein G-D-S-L family  41.41 
 
 
285 aa  157  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.79 
 
 
327 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  28.83 
 
 
322 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  29.24 
 
 
327 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5253  hypothetical protein  31.46 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.209286  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.55 
 
 
329 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  34.21 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  34.21 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0766  hypothetical protein  28.24 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0644448  hitchhiker  0.00367044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0789  hypothetical protein  30.37 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161897  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  31.43 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  31.02 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  31.02 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.9 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  31.84 
 
 
267 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  29.63 
 
 
275 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0900  hypothetical protein  30.18 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0137  hypothetical protein  27.16 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  27.8 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0221  hypothetical protein  28.57 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  31.31 
 
 
277 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4911  hypothetical protein  29.31 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.797649 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  28.57 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  31.05 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1136  lipolytic protein G-D-S-L family  26.74 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.527097  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3748  GDSL family lipase  28.8 
 
 
300 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  27.18 
 
 
238 aa  64.3  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  31.33 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  31.76 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.03 
 
 
270 aa  55.8  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  28.93 
 
 
189 aa  53.9  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  29.41 
 
 
201 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  31.2 
 
 
219 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  27.42 
 
 
223 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  26.29 
 
 
239 aa  49.7  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2989  GDSL family lipase  25.14 
 
 
203 aa  49.7  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.816827  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2928  acyl-CoA thioesterase I, putative  25.85 
 
 
227 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  25.49 
 
 
201 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.4 
 
 
226 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3205  GDSL family lipase  26.21 
 
 
201 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765552  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2068  arylesterase  28.99 
 
 
217 aa  47  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1537  GDSL family lipase  25.64 
 
 
199 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131898 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1543  arylesterase  25 
 
 
199 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  30.65 
 
 
201 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23070  Arylesterase protein  28.57 
 
 
198 aa  45.8  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.803817  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1478  arylesterase  25 
 
 
199 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2311  acyl-CoA thioesterase I  29.25 
 
 
226 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328666  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1384  arylesterase  28.33 
 
 
201 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.015235  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1401  arylesterase  29.17 
 
 
226 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  29.27 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  29.03 
 
 
201 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  29.03 
 
 
201 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1355  GDSL family lipase  31.3 
 
 
184 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260429  normal  0.647908 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  27.42 
 
 
205 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1837  lysophospholipase  31.3 
 
 
201 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal  0.074561 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  28 
 
 
200 aa  43.5  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  29.03 
 
 
199 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0488  GDSL family lipase  29.7 
 
 
203 aa  43.5  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307636  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1907  arylesterase  31.3 
 
 
225 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0973047  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  26.61 
 
 
223 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3412  arylesterase  29.13 
 
 
182 aa  43.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.634502  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2077  lipolytic protein G-D-S-L family  26.09 
 
 
241 aa  43.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3558  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.86 
 
 
201 aa  43.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0285978  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  25.17 
 
 
204 aa  42.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1942  GDSL family lipase  30.43 
 
 
222 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2242  Arylesterase  30.87 
 
 
200 aa  42.7  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0186506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1919  GDSL family lipase  30.43 
 
 
222 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  27.42 
 
 
241 aa  42.7  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  27.19 
 
 
209 aa  42.7  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  27.42 
 
 
241 aa  42.7  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  28.69 
 
 
201 aa  42.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5220  lipolytic protein  30.43 
 
 
224 aa  42.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  28.33 
 
 
201 aa  42.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  28.44 
 
 
216 aa  42.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  25.62 
 
 
202 aa  42  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177051 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>