41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3870 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3870  putative lipase  100 
 
 
239 aa  495  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.749883  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4377  putative lipase  53.85 
 
 
238 aa  256  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  27.46 
 
 
201 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2077  lipolytic protein G-D-S-L family  28.04 
 
 
241 aa  67  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.78 
 
 
327 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  36.59 
 
 
379 aa  56.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4136  hypothetical protein  42.42 
 
 
448 aa  55.8  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0594523  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  27.18 
 
 
209 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  27.78 
 
 
322 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  25.66 
 
 
225 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  27.11 
 
 
238 aa  52.4  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  33.05 
 
 
275 aa  52  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  33.05 
 
 
286 aa  52  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  36.59 
 
 
327 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  32.17 
 
 
269 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  28.87 
 
 
214 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  27.23 
 
 
214 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  33.05 
 
 
275 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.9 
 
 
329 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  28 
 
 
318 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3591  hypothetical protein  43.75 
 
 
451 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0183177  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  28.24 
 
 
204 aa  48.1  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  24.1 
 
 
303 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4035  arylesterase  35.29 
 
 
214 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0926755 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  31.62 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2714  lipolytic protein  29.77 
 
 
200 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345336 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  29.28 
 
 
216 aa  46.6  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1973  arylesterase  23.79 
 
 
208 aa  46.6  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  34.09 
 
 
279 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3444  arylesterase  25.86 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000206648 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2625  hypothetical protein  24.87 
 
 
469 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  29.53 
 
 
219 aa  45.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  28.28 
 
 
267 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  30.14 
 
 
267 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  29.21 
 
 
250 aa  43.5  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0549  arylesterase  27.61 
 
 
219 aa  43.5  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.65296  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  28.28 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1716  lipolytic protein  24.74 
 
 
194 aa  43.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000204836  normal  0.492944 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2424  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.9 
 
 
178 aa  42.4  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  23.08 
 
 
202 aa  42.4  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0742  hypothetical protein  23.29 
 
 
365 aa  42  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>