30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4377 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4377  putative lipase  100 
 
 
238 aa  492  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3870  putative lipase  53.85 
 
 
239 aa  251  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.749883  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  29.49 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2077  lipolytic protein G-D-S-L family  27.31 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  34.31 
 
 
379 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3582  lipolytic protein G-D-S-L family  27.27 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3393  lipolytic protein G-D-S-L family  23.19 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0644196  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.02 
 
 
327 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1973  arylesterase  27.35 
 
 
208 aa  49.7  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0817  lipolytic protein G-D-S-L family  27.06 
 
 
331 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00788434 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0443  GDSL family lipase  24.64 
 
 
213 aa  48.5  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.665716  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.81 
 
 
303 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3591  hypothetical protein  24.85 
 
 
451 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0183177  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  28.12 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1523  lipolytic protein G-D-S-L family  22.12 
 
 
220 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  31.37 
 
 
318 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4136  hypothetical protein  44.9 
 
 
448 aa  47  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0594523  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  27.27 
 
 
322 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  29.01 
 
 
225 aa  45.1  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28 
 
 
329 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2606  lipolytic protein G-D-S-L family  23.86 
 
 
457 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00170788  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3558  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.11 
 
 
201 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0285978  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0742  hypothetical protein  24.47 
 
 
365 aa  43.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  34.92 
 
 
327 aa  42.7  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2714  lipolytic protein  27.68 
 
 
200 aa  42.4  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345336 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2625  hypothetical protein  25.37 
 
 
469 aa  42.4  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0553  lipolytic protein G-D-S-L family  23.73 
 
 
214 aa  42  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  25.76 
 
 
220 aa  42  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2692  lipolytic protein G-D-S-L family  25.84 
 
 
217 aa  41.6  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  27.68 
 
 
215 aa  41.6  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>