168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0790 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  100 
 
 		 318 aa  640    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  79.28 
 
 		 303 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  71.52 
 
 		 329 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  74.24 
 
 		 322 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  64 
 
 		 379 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  57.76 
 
 		 327 aa  385  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  61.07 
 
 		 327 aa  347  2e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  41.15 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  44.88 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  42.16 
 
 		 275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  42.16 
 
 		 286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  42.16 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  44.76 
 
 		 279 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  42.72 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  41.87 
 
 		 267 aa  122  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  41.87 
 
 		 267 aa  122  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  40.89 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1136  lipolytic protein G-D-S-L family  34.95 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.527097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4911  hypothetical protein  33.95 
 
 		 254 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.797649 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  35.24 
 
 		 250 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0766  hypothetical protein  30.7 
 
 		 252 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0644448  hitchhiker  0.00367044 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3748  GDSL family lipase  39.9 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2227  lipolytic protein G-D-S-L family  35.07 
 
 		 285 aa  100  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5253  hypothetical protein  29.79 
 
 		 259 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.209286  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0789  hypothetical protein  31.63 
 
 		 259 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161897  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0137  hypothetical protein  29.49 
 
 		 253 aa  89.7  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0221  hypothetical protein  34.52 
 
 		 253 aa  89.4  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0988  hypothetical protein  27.54 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0951  hypothetical protein  27.83 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2374  hypothetical protein  27.03 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  hitchhiker  0.00086593 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0900  hypothetical protein  30.32 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5560  hypothetical protein  31.25 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0929  hypothetical protein  26.79 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5410  hypothetical protein  27.39 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  30.3 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  30.56 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  29.8 
 
 		 223 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  29.5 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  37.25 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.21 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2630  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.05 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0895129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  33.33 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  32.43 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  26.53 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  26.29 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  29.85 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  25.77 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  31.15 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  31.58 
 
 		 216 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  30.11 
 
 		 241 aa  58.9  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  34.85 
 
 		 202 aa  58.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  33.94 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  29.55 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  28.08 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.08 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  31.29 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1745  GDSL family lipase  35.78 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0864047  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  26.9 
 
 		 214 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  31.29 
 
 		 205 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  27.09 
 
 		 213 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  35.09 
 
 		 201 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1152  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.22 
 
 		 227 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  29.44 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  36.61 
 
 		 266 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  34.86 
 
 		 202 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  34.26 
 
 		 216 aa  53.9  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  30.27 
 
 		 204 aa  53.5  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2409  arylesterase  28.41 
 
 		 204 aa  53.1  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170275 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2989  GDSL family lipase  30 
 
 		 203 aa  53.1  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.816827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  29.88 
 
 		 204 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  30.72 
 
 		 201 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  28.73 
 
 		 216 aa  53.1  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1054  Lysophospholipase  26.47 
 
 		 212 aa  52.8  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  29.14 
 
 		 209 aa  52.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  28 
 
 		 205 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  26.47 
 
 		 215 aa  52.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2149  putative lipase  33.94 
 
 		 203 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.208079 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.33 
 
 		 225 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1015  lysophospholipase L1 or related esterase  29.81 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3602  hypothetical protein  26.47 
 
 		 685 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  25.87 
 
 		 220 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2392  arylesterase  23.98 
 
 		 199 aa  50.8  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  29.14 
 
 		 210 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  28.64 
 
 		 255 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3734  GDSL family lipase  39.29 
 
 		 207 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00414819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  26.09 
 
 		 225 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0285  arylesterase precursor  22.75 
 
 		 206 aa  50.1  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1921  lipolytic protein G-D-S-L family  29.95 
 
 		 198 aa  50.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04660  acyl-CoA thioesterase I  27.81 
 
 		 217 aa  50.1  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0171424  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  24 
 
 		 214 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  26.54 
 
 		 261 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  28.08 
 
 		 201 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3870  putative lipase  28 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.749883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.86 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  38.64 
 
 		 234 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  29.21 
 
 		 214 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  30.83 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  29.14 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  25 
 
 		 195 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  38.71 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>