117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5252 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 		 322 aa  651    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  79.92 
 
 		 303 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  65.85 
 
 		 329 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  74.24 
 
 		 318 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  58.41 
 
 		 327 aa  397  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  61.59 
 
 		 379 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  64.75 
 
 		 327 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  40.2 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  37.56 
 
 		 269 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  40.2 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  40.2 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  40.98 
 
 		 238 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  40 
 
 		 279 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  38.79 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  38.79 
 
 		 267 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  37.96 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  40.59 
 
 		 277 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2227  lipolytic protein G-D-S-L family  35.92 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4911  hypothetical protein  32.09 
 
 		 254 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.797649 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  33.64 
 
 		 250 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0766  hypothetical protein  31.42 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0644448  hitchhiker  0.00367044 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3748  GDSL family lipase  36.7 
 
 		 300 aa  99  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0988  hypothetical protein  29.09 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5253  hypothetical protein  30.88 
 
 		 259 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.209286  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0951  hypothetical protein  29.09 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1136  lipolytic protein G-D-S-L family  31.79 
 
 		 221 aa  96.3  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.527097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0929  hypothetical protein  28.64 
 
 		 270 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0789  hypothetical protein  32.67 
 
 		 259 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161897  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5560  hypothetical protein  29.55 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5410  hypothetical protein  28.83 
 
 		 288 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2374  hypothetical protein  27.06 
 
 		 276 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  hitchhiker  0.00086593 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0900  hypothetical protein  31.22 
 
 		 259 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0221  hypothetical protein  30.37 
 
 		 253 aa  85.9  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0137  hypothetical protein  28.02 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  27.72 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.63 
 
 		 226 aa  62  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  29.17 
 
 		 223 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  33.87 
 
 		 213 aa  62.4  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  30.94 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2630  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.95 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0895129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  29 
 
 		 223 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  28 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  28.71 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  27.62 
 
 		 213 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.88 
 
 		 225 aa  54.3  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3870  putative lipase  27.78 
 
 		 239 aa  53.9  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.749883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  33.04 
 
 		 266 aa  53.5  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  33.64 
 
 		 201 aa  53.5  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.75 
 
 		 270 aa  53.5  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  27.81 
 
 		 215 aa  53.5  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1745  GDSL family lipase  33.33 
 
 		 242 aa  52.8  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0864047  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  26.63 
 
 		 200 aa  52.8  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2149  putative lipase  29.19 
 
 		 203 aa  52  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.208079 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  30.37 
 
 		 209 aa  52.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  27.13 
 
 		 216 aa  52  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1523  lipolytic protein G-D-S-L family  30.77 
 
 		 220 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  29.28 
 
 		 240 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  27.36 
 
 		 189 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  34.55 
 
 		 202 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  24.26 
 
 		 200 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3602  hypothetical protein  24.89 
 
 		 685 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  26.24 
 
 		 239 aa  50.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  28.25 
 
 		 195 aa  50.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2989  GDSL family lipase  31.38 
 
 		 203 aa  50.1  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.816827  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  27.68 
 
 		 241 aa  49.7  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  27.68 
 
 		 241 aa  49.3  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  32.24 
 
 		 240 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2392  arylesterase  22.94 
 
 		 199 aa  49.3  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  28.41 
 
 		 216 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2928  acyl-CoA thioesterase I, putative  26 
 
 		 227 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2409  arylesterase  29.46 
 
 		 204 aa  47.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170275 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  27.78 
 
 		 213 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2141  GDSL family lipase  23.71 
 
 		 189 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.953926  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  29.41 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0285  arylesterase precursor  24.56 
 
 		 206 aa  47.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  29.57 
 
 		 214 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  37.18 
 
 		 201 aa  47.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  29.82 
 
 		 214 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  27.78 
 
 		 255 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  29.7 
 
 		 202 aa  47  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  25 
 
 		 225 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2263  hypothetical protein  23.44 
 
 		 371 aa  46.6  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  39.77 
 
 		 234 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  23.65 
 
 		 220 aa  46.6  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0553  lipolytic protein G-D-S-L family  36.51 
 
 		 214 aa  46.6  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0686  acyl-CoA thioesterase I precursor  27.19 
 
 		 206 aa  46.2  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0488  GDSL family lipase  40.24 
 
 		 203 aa  46.2  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  26.47 
 
 		 201 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2112  lipolytic protein G-D-S-L family  28.08 
 
 		 218 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.835545 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1478  arylesterase  24.12 
 
 		 199 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1543  arylesterase  24.12 
 
 		 199 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4377  putative lipase  27.27 
 
 		 238 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  30.95 
 
 		 204 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  25.12 
 
 		 261 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3427  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  25.13 
 
 		 188 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3118  esterase  27.18 
 
 		 188 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06060  lysophospholipase L1-like esterase  24.54 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105705  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1537  GDSL family lipase  24.12 
 
 		 199 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131898 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  27.08 
 
 		 233 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3734  GDSL family lipase  34.38 
 
 		 207 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00414819  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>