57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2625 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2625  hypothetical protein  100 
 
 
469 aa  941    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2311  hypothetical protein  89.56 
 
 
185 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.925617  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  29.63 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5611  lipolytic protein G-D-S-L family  23.91 
 
 
589 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  27.64 
 
 
225 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2692  lipolytic protein G-D-S-L family  26.58 
 
 
217 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2077  lipolytic protein G-D-S-L family  25.48 
 
 
241 aa  56.6  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0650  GDSL family lipase  27.85 
 
 
219 aa  55.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2141  GDSL family lipase  28.72 
 
 
189 aa  54.7  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.953926  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2308  GDSL family lipase/acylhydrolase  25.13 
 
 
206 aa  52.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85334  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0553  lipolytic protein G-D-S-L family  25.24 
 
 
214 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2599  lipolytic protein G-D-S-L family  26.34 
 
 
213 aa  52.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  29.17 
 
 
226 aa  52.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2709  arylesterase  24.29 
 
 
216 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3416  esterase  27.04 
 
 
188 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0484902  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1678  Arylesterase  24.29 
 
 
185 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740826  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2785  arylesterase  24.29 
 
 
185 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.761375  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0686  acyl-CoA thioesterase I precursor  23.16 
 
 
206 aa  51.2  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2928  acyl-CoA thioesterase I, putative  25.71 
 
 
227 aa  50.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2688  arylesterase  24.29 
 
 
199 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1478  arylesterase  25 
 
 
199 aa  50.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3094  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
266 aa  50.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466752  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1537  GDSL family lipase  25 
 
 
199 aa  50.1  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131898 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1543  arylesterase  25 
 
 
199 aa  50.4  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2263  hypothetical protein  24.2 
 
 
371 aa  49.3  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0769  lipolytic protein G-D-S-L family  28.91 
 
 
258 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0828  lipolytic enzyme, G-D-S-L  22.92 
 
 
500 aa  48.5  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0189609  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1485  arylesterase  24.31 
 
 
195 aa  48.5  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2392  arylesterase  23.57 
 
 
199 aa  47.8  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  27.13 
 
 
223 aa  47.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4445  lipolytic protein G-D-S-L family  26.27 
 
 
230 aa  47  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.185378  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19520  lysophospholipase L1-like esterase  24.62 
 
 
209 aa  47  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.347124  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1156  lipolytic protein G-D-S-L family  33.33 
 
 
266 aa  47  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866129  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1259  lipolytic protein G-D-S-L family  26.05 
 
 
725 aa  45.8  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.437163  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  22.45 
 
 
209 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3443  esterase  25.26 
 
 
188 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2403  arylesterase  26.21 
 
 
197 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3118  esterase  24.23 
 
 
188 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2048  lipolytic protein G-D-S-L family  25.82 
 
 
207 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.137191 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3021  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  21.35 
 
 
211 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.116917  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3870  putative lipase  24.87 
 
 
239 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.749883  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1271  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  21.35 
 
 
216 aa  44.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.934354  normal  0.745866 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3159  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  21.35 
 
 
190 aa  45.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.681628  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  22.28 
 
 
195 aa  45.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1070  GDSL family lipase  25 
 
 
259 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1716  lipolytic protein  25.73 
 
 
194 aa  45.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000204836  normal  0.492944 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1044  arylesterase  21.47 
 
 
213 aa  44.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4246  GDSL family lipase  34.52 
 
 
218 aa  44.3  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50953  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1639  lipolytic protein G-D-S-L family  23.46 
 
 
654 aa  44.3  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1242  lipolytic protein G-D-S-L family  28.08 
 
 
251 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0146465  normal  0.0264869 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  26.6 
 
 
223 aa  43.9  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  29.89 
 
 
249 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0285  arylesterase precursor  22.68 
 
 
206 aa  43.9  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2409  arylesterase  22.6 
 
 
204 aa  43.9  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170275 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0443  GDSL family lipase  27.27 
 
 
213 aa  43.9  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.665716  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1526  GDSL family lipase  27.07 
 
 
206 aa  43.9  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0224358  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  23.08 
 
 
277 aa  43.1  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0380541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>