129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4910 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  100 
 
 		 329 aa  668    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  78.81 
 
 		 303 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  78.33 
 
 		 318 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  69.8 
 
 		 322 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  67.21 
 
 		 379 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  61.85 
 
 		 327 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  65.79 
 
 		 327 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  44.39 
 
 		 238 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  39.23 
 
 		 269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  42.72 
 
 		 275 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  42.72 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  41.75 
 
 		 275 aa  143  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  43.19 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  41.75 
 
 		 277 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  37.38 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  37.38 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  36.92 
 
 		 267 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0766  hypothetical protein  34.88 
 
 		 252 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0644448  hitchhiker  0.00367044 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  35.75 
 
 		 250 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4911  hypothetical protein  33.49 
 
 		 254 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.797649 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2227  lipolytic protein G-D-S-L family  35.43 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5253  hypothetical protein  31.34 
 
 		 259 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.209286  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1136  lipolytic protein G-D-S-L family  31.07 
 
 		 221 aa  96.3  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.527097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0988  hypothetical protein  28.4 
 
 		 328 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0951  hypothetical protein  28.4 
 
 		 327 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3748  GDSL family lipase  37.19 
 
 		 300 aa  92.4  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5560  hypothetical protein  32.76 
 
 		 289 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0929  hypothetical protein  28.85 
 
 		 270 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0137  hypothetical protein  29.86 
 
 		 253 aa  90.9  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0789  hypothetical protein  31.63 
 
 		 259 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161897  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2374  hypothetical protein  27.48 
 
 		 276 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  hitchhiker  0.00086593 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0221  hypothetical protein  29.17 
 
 		 253 aa  90.1  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0900  hypothetical protein  30.64 
 
 		 259 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5410  hypothetical protein  29.55 
 
 		 288 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  31.67 
 
 		 204 aa  67  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  30.1 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.27 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  31.66 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  30.3 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  37.29 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  30.87 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  28.96 
 
 		 213 aa  57  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  27.23 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2630  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.61 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0895129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  31.08 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1745  GDSL family lipase  35.78 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0864047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  31.43 
 
 		 205 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.53 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  29.29 
 
 		 240 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2989  GDSL family lipase  32.45 
 
 		 203 aa  54.3  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.816827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1523  lipolytic protein G-D-S-L family  31.43 
 
 		 220 aa  53.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  34.26 
 
 		 216 aa  53.1  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0553  lipolytic protein G-D-S-L family  35.37 
 
 		 214 aa  53.1  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  29.78 
 
 		 209 aa  52.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  28.22 
 
 		 219 aa  52.8  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  34.55 
 
 		 202 aa  52.8  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  29.88 
 
 		 202 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2141  GDSL family lipase  26.8 
 
 		 189 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.953926  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  25.51 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  29.28 
 
 		 204 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  28.14 
 
 		 255 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1919  GDSL family lipase  31.17 
 
 		 222 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  26.7 
 
 		 239 aa  50.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1942  GDSL family lipase  31.91 
 
 		 222 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  29.28 
 
 		 266 aa  50.1  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3734  GDSL family lipase  39.58 
 
 		 207 aa  50.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00414819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  29.93 
 
 		 205 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2149  putative lipase  28.65 
 
 		 203 aa  49.7  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.208079 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  26.67 
 
 		 213 aa  49.7  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  28.65 
 
 		 216 aa  49.3  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3870  putative lipase  31.9 
 
 		 239 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.749883  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  30 
 
 		 201 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  26.88 
 
 		 201 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  34 
 
 		 240 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  27.37 
 
 		 233 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  29.15 
 
 		 189 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3278  hypothetical protein  26.44 
 
 		 229 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  25 
 
 		 447 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  28.73 
 
 		 216 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  31.5 
 
 		 202 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  25 
 
 		 220 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2392  arylesterase  24.12 
 
 		 199 aa  47.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  27.21 
 
 		 214 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5220  lipolytic protein  32.82 
 
 		 224 aa  46.6  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.9 
 
 		 225 aa  46.6  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1015  lysophospholipase L1 or related esterase  28.29 
 
 		 299 aa  47  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  26.04 
 
 		 215 aa  46.6  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  25.43 
 
 		 200 aa  46.6  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  29.68 
 
 		 255 aa  47  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  25.57 
 
 		 241 aa  46.6  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6160  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.54 
 
 		 184 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  25.57 
 
 		 241 aa  46.6  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  29.19 
 
 		 201 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  31.09 
 
 		 260 aa  46.2  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3118  esterase  25 
 
 		 188 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3427  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  23.59 
 
 		 188 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0686  acyl-CoA thioesterase I precursor  25.5 
 
 		 206 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3591  hypothetical protein  28.89 
 
 		 451 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0183177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  29.2 
 
 		 201 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1829  esterase  25.76 
 
 		 188 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0305538  normal  0.13667 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>