101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3278 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3278  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  466  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2667  GDSL family lipase  42.01 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24646  hitchhiker  0.000175501 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2484  GDSL family lipase  38.64 
 
 		 234 aa  155  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0156  lipolytic protein G-D-S-L family  41.18 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0132621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3268  lipolytic protein G-D-S-L family  35 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  32.04 
 
 		 197 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  27.1 
 
 		 211 aa  94.7  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  30 
 
 		 196 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  28.64 
 
 		 197 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  28.64 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  28.64 
 
 		 197 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  30.05 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1363  lipolytic protein G-D-S-L family  33.87 
 
 		 289 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  28.89 
 
 		 196 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1326  GDSL family lipase  33.15 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  32.07 
 
 		 197 aa  89.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06060  lysophospholipase L1-like esterase  30.66 
 
 		 297 aa  87.4  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105705  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2060  lipolytic protein G-D-S-L family  31.9 
 
 		 281 aa  87  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4413  GDSL family lipase  29.17 
 
 		 266 aa  86.3  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0027  GDSL family lipase  27.72 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0023  GDSL family lipase  26.37 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0263  lipolytic protein G-D-S-L family  30.3 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3730  lipolytic protein G-D-S-L family  30.6 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2945  lipolytic protein G-D-S-L family  29.78 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1490  lipolytic protein G-D-S-L family  30.43 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3930  GDSL family lipase  27.81 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34730  lysophospholipase L1-like esterase  29.71 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0437206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2206  lipolytic protein G-D-S-L family  27.32 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.235445 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3727  lipolytic protein G-D-S-L family  28.02 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1065  lipolytic protein G-D-S-L family  28.42 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2321  lipase/acylhydrolase  35.29 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183981  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0072  GDSL family lipase  29.57 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3925  GDSL family lipase  26.92 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31650  lysophospholipase L1-like esterase  29.72 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  29.21 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6531  hypothetical protein  28.21 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.0269756 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  29.14 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19770  lysophospholipase L1-like esterase  27.04 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  hitchhiker  0.000837214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  28.8 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  28.42 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0855  hypothetical protein  28.73 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335493  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0386  lipolytic protein G-D-S-L family  28.98 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0684  lipolytic protein G-D-S-L family  30.57 
 
 		 273 aa  72  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0974788  hitchhiker  0.0000166957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.87 
 
 		 270 aa  72  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0731  lipolytic protein G-D-S-L family  29.44 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3065  lipolytic protein G-D-S-L family  26.77 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0811  lipolytic protein G-D-S-L family  24.89 
 
 		 333 aa  65.1  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.0157392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0732  lipolytic protein G-D-S-L family  28.18 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2928  GDSL family lipase  25.97 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2914  GDSL family lipase  25.97 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  27.12 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2884  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.97 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0469503  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23280  lysophospholipase L1-like esterase  30.43 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21860  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  26.76 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00185801  normal  0.684974 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2954  lipolytic protein G-D-S-L family  25.67 
 
 		 319 aa  58.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  24.58 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0254  lipolytic protein G-D-S-L family  27.32 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3183  GDSL family lipase  24.31 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2275  lipolytic protein G-D-S-L family  24.75 
 
 		 278 aa  55.1  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  26.55 
 
 		 195 aa  53.5  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2409  arylesterase  25.82 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170275 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  30.33 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1678  Arylesterase  26.5 
 
 		 185 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740826  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.44 
 
 		 329 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2688  arylesterase  27.2 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2928  acyl-CoA thioesterase I, putative  25.54 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1478  arylesterase  25.79 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2403  arylesterase  26.37 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2392  arylesterase  25.41 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  25 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2709  arylesterase  26.5 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1660  arylesterase  28.32 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1537  GDSL family lipase  25.79 
 
 		 199 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131898 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2785  arylesterase  25.64 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.761375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1543  arylesterase  26.4 
 
 		 199 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  25.37 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  27.19 
 
 		 255 aa  45.8  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  28.07 
 
 		 205 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  24.15 
 
 		 215 aa  45.4  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  29.46 
 
 		 213 aa  45.4  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  28.18 
 
 		 214 aa  45.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  28.02 
 
 		 202 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1044  arylesterase  28.3 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2237  GDSL family lipase  36.36 
 
 		 284 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0161232 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  29.31 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2620  arylesterase  25.89 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403084  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5121  GDSL family lipase  24.32 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245752  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  27.68 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.28 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  26.29 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  30.91 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  25.86 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  26.55 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1485  arylesterase  27.43 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2898  arylesterase  24.17 
 
 		 190 aa  43.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179811  hitchhiker  0.000609296 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  26.7 
 
 		 205 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  27.12 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1696  arylesterase  24.61 
 
 		 198 aa  42.4  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.122865  normal  0.277119 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1054  Lysophospholipase  27.89 
 
 		 212 aa  42.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  23.35 
 
 		 200 aa  42  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>