64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0951 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0951  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  662    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0988  hypothetical protein  98.78 
 
 
328 aa  653    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0929  hypothetical protein  93.75 
 
 
270 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5410  hypothetical protein  59.7 
 
 
288 aa  305  7e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465683  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5560  hypothetical protein  65.32 
 
 
289 aa  286  4e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2374  hypothetical protein  59 
 
 
276 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  hitchhiker  0.00086593 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  39.51 
 
 
250 aa  172  5.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2227  lipolytic protein G-D-S-L family  40.91 
 
 
285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  29.09 
 
 
322 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4911  hypothetical protein  34.62 
 
 
254 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.797649 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0789  hypothetical protein  33.2 
 
 
259 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161897  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5253  hypothetical protein  34.44 
 
 
259 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.209286  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0137  hypothetical protein  33.88 
 
 
253 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.4 
 
 
329 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.29 
 
 
327 aa  94.4  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0766  hypothetical protein  30.43 
 
 
252 aa  94.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0644448  hitchhiker  0.00367044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  33.33 
 
 
275 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  33.33 
 
 
286 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  28 
 
 
327 aa  89.7  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0221  hypothetical protein  33.7 
 
 
253 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0900  hypothetical protein  31.32 
 
 
259 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  32.11 
 
 
275 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  27.83 
 
 
318 aa  85.9  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  31.67 
 
 
267 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  29.18 
 
 
269 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.75 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  32.52 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  32.52 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  31.12 
 
 
238 aa  78.2  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  32.87 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  27.18 
 
 
379 aa  70.5  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  33.8 
 
 
251 aa  62.8  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  32.24 
 
 
277 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1136  lipolytic protein G-D-S-L family  27.13 
 
 
221 aa  62.4  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.527097  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3748  GDSL family lipase  28.71 
 
 
300 aa  60.5  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  33.57 
 
 
210 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  28.38 
 
 
266 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.97 
 
 
211 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  31.97 
 
 
202 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  26.6 
 
 
239 aa  54.3  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  37.93 
 
 
213 aa  53.1  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  29.37 
 
 
204 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  27.67 
 
 
201 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  29.52 
 
 
226 aa  51.2  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  29.2 
 
 
270 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.94 
 
 
204 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  34.58 
 
 
204 aa  49.7  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  31.21 
 
 
219 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.44 
 
 
270 aa  47  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3412  arylesterase  26.95 
 
 
182 aa  47.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.634502  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  27.66 
 
 
241 aa  46.6  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  29.57 
 
 
209 aa  46.6  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  27.66 
 
 
241 aa  46.6  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  32.11 
 
 
240 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  28.3 
 
 
223 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  30.34 
 
 
216 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2112  lipolytic protein G-D-S-L family  30.46 
 
 
218 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.835545 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  30.67 
 
 
189 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4035  arylesterase  26.92 
 
 
214 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0926755 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1829  esterase  28.46 
 
 
188 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0305538  normal  0.13667 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2979  hypothetical protein  25.19 
 
 
295 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000369688  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  31.18 
 
 
213 aa  43.5  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2077  lipolytic protein G-D-S-L family  27.96 
 
 
241 aa  43.5  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  29.91 
 
 
216 aa  42.7  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>