49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5253 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5253  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.209286  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0789  hypothetical protein  67.57 
 
 		 259 aa  354  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161897  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0900  hypothetical protein  68.08 
 
 		 259 aa  351  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4911  hypothetical protein  58.46 
 
 		 254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.797649 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0221  hypothetical protein  59.2 
 
 		 253 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0766  hypothetical protein  56.25 
 
 		 252 aa  285  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0644448  hitchhiker  0.00367044 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0137  hypothetical protein  54.08 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.34 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  30.88 
 
 		 322 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0951  hypothetical protein  34.44 
 
 		 327 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0988  hypothetical protein  34.44 
 
 		 328 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  29.79 
 
 		 318 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.09 
 
 		 327 aa  95.9  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0929  hypothetical protein  34.44 
 
 		 270 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  30.84 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  29.31 
 
 		 327 aa  93.2  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2374  hypothetical protein  32.04 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  hitchhiker  0.00086593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  29.36 
 
 		 379 aa  89.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2227  lipolytic protein G-D-S-L family  32.97 
 
 		 285 aa  88.6  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.28 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  30.67 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  30.67 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5560  hypothetical protein  31.07 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5410  hypothetical protein  31.46 
 
 		 288 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  32.76 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  30.22 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  31.76 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  30.6 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  31.05 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  28.83 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  27.86 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  27.1 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1136  lipolytic protein G-D-S-L family  26.23 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.527097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  31.31 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  32.04 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  28.38 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  28.23 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  28.38 
 
 		 201 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  27.64 
 
 		 205 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3748  GDSL family lipase  34.12 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  26.35 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  28.31 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  30.67 
 
 		 201 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  30.41 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  26.35 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1401  arylesterase  28.44 
 
 		 226 aa  42.7  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  27.97 
 
 		 201 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3005  Lysophospholipase  29.36 
 
 		 182 aa  42.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.890244  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0651  Lysophospholipase  27.59 
 
 		 214 aa  42  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.623159  normal  0.969568 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>