46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1136 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1136  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
221 aa  447  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.527097  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  45.63 
 
 
267 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  45.63 
 
 
267 aa  159  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  45.63 
 
 
267 aa  159  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  48.04 
 
 
279 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  46.73 
 
 
277 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  39.62 
 
 
269 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  42.42 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  42.42 
 
 
286 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  40.4 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  34.95 
 
 
318 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.04 
 
 
303 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.07 
 
 
329 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.99 
 
 
327 aa  96.3  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  31.79 
 
 
322 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  34.31 
 
 
327 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  31.28 
 
 
379 aa  89  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  27.83 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2227  lipolytic protein G-D-S-L family  30.19 
 
 
285 aa  78.6  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  30 
 
 
238 aa  77  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5410  hypothetical protein  26.74 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465683  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5560  hypothetical protein  28.37 
 
 
289 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0766  hypothetical protein  21.74 
 
 
252 aa  65.1  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0644448  hitchhiker  0.00367044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0951  hypothetical protein  27.13 
 
 
327 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0988  hypothetical protein  27.13 
 
 
328 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2374  hypothetical protein  28.04 
 
 
276 aa  62  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  hitchhiker  0.00086593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0929  hypothetical protein  26.6 
 
 
270 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3748  GDSL family lipase  33.95 
 
 
300 aa  58.5  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0789  hypothetical protein  27.05 
 
 
259 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161897  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4911  hypothetical protein  20.67 
 
 
254 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.797649 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0137  hypothetical protein  26.36 
 
 
253 aa  55.8  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5253  hypothetical protein  26.23 
 
 
259 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.209286  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0900  hypothetical protein  24.79 
 
 
259 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0221  hypothetical protein  22.33 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  25 
 
 
201 aa  46.6  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19520  lysophospholipase L1-like esterase  28.17 
 
 
209 aa  45.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.347124  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0503  lipase/acylhydrolase  28.87 
 
 
279 aa  45.8  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2989  GDSL family lipase  29.19 
 
 
203 aa  45.8  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.816827  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  24.75 
 
 
220 aa  45.4  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  28.8 
 
 
202 aa  45.4  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2692  lipolytic protein G-D-S-L family  26.95 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2149  putative lipase  27.86 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.208079 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0522  lysophospholipase L1 related esterase  23.39 
 
 
279 aa  44.3  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2263  hypothetical protein  21.72 
 
 
371 aa  43.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1745  GDSL family lipase  26.46 
 
 
242 aa  42.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0864047  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2269  GDSL family lipase  22.86 
 
 
235 aa  42.4  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0100927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>