54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0900 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0900  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0789  hypothetical protein  83.4 
 
 		 259 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161897  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5253  hypothetical protein  68.08 
 
 		 259 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.209286  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4911  hypothetical protein  64.37 
 
 		 254 aa  340  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.797649 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0221  hypothetical protein  60.4 
 
 		 253 aa  322  3e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0766  hypothetical protein  59.26 
 
 		 252 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0644448  hitchhiker  0.00367044 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0137  hypothetical protein  54.66 
 
 		 253 aa  290  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  31.14 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0929  hypothetical protein  36.22 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0951  hypothetical protein  31.67 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0988  hypothetical protein  33.78 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  34.26 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  34.26 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.64 
 
 		 329 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  31.22 
 
 		 322 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  33.06 
 
 		 275 aa  92  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  31.03 
 
 		 379 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2374  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  hitchhiker  0.00086593 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  29.86 
 
 		 327 aa  89.7  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5410  hypothetical protein  30.63 
 
 		 288 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  30.32 
 
 		 318 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.98 
 
 		 327 aa  86.7  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.48 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  30.66 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  31.93 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  30.8 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  30.8 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  30.04 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5560  hypothetical protein  29.82 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2227  lipolytic protein G-D-S-L family  28 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  33.33 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  29.05 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1136  lipolytic protein G-D-S-L family  25.81 
 
 		 221 aa  53.9  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.527097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3020  GDSL family lipase  33.33 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242695 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  25.88 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  32.46 
 
 		 201 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  31.15 
 
 		 201 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  30.7 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  28.7 
 
 		 201 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  28.07 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  30.2 
 
 		 240 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  31.01 
 
 		 202 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0651  Lysophospholipase  29.57 
 
 		 214 aa  45.4  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.623159  normal  0.969568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  30.7 
 
 		 201 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  31.58 
 
 		 205 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  29.82 
 
 		 199 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  30.7 
 
 		 201 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3412  arylesterase  30.7 
 
 		 182 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.634502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3748  GDSL family lipase  29.81 
 
 		 300 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1384  arylesterase  30.2 
 
 		 201 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.015235  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  29.41 
 
 		 205 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  27.87 
 
 		 210 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3031  arylesterase  30.7 
 
 		 202 aa  42.7  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0119221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4035  arylesterase  29.82 
 
 		 214 aa  42.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>