49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0766 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0766  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0644448  hitchhiker  0.00367044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4911  hypothetical protein  64.4 
 
 		 254 aa  343  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.797649 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0221  hypothetical protein  62.65 
 
 		 253 aa  329  3e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0137  hypothetical protein  61.29 
 
 		 253 aa  324  8.000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0900  hypothetical protein  59.26 
 
 		 259 aa  288  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0789  hypothetical protein  54.4 
 
 		 259 aa  288  7e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161897  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5253  hypothetical protein  56.25 
 
 		 259 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.209286  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.88 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  33.18 
 
 		 275 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  33.18 
 
 		 286 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  31.06 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  33.19 
 
 		 275 aa  105  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  31.42 
 
 		 322 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  30.7 
 
 		 318 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2374  hypothetical protein  33.15 
 
 		 276 aa  101  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  hitchhiker  0.00086593 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  34.11 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.7 
 
 		 303 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  34 
 
 		 279 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0929  hypothetical protein  30.98 
 
 		 270 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  31.68 
 
 		 379 aa  95.5  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  29.82 
 
 		 327 aa  95.5  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.64 
 
 		 327 aa  95.1  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0988  hypothetical protein  30.43 
 
 		 328 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0951  hypothetical protein  30.43 
 
 		 327 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  29.94 
 
 		 250 aa  85.9  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5410  hypothetical protein  28.24 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  32.18 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  29.37 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  29.37 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  28.97 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5560  hypothetical protein  28.5 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2227  lipolytic protein G-D-S-L family  29.73 
 
 		 285 aa  75.5  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1136  lipolytic protein G-D-S-L family  21.74 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.527097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3748  GDSL family lipase  31.02 
 
 		 300 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  28.19 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  29.69 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  27.67 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3005  Lysophospholipase  27.21 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.890244  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  27.62 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  27.35 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  27.08 
 
 		 201 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  25.6 
 
 		 204 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  25 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  24.84 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  27.19 
 
 		 200 aa  43.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.97 
 
 		 204 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1157  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  25.85 
 
 		 196 aa  42  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.987019  hitchhiker  0.000093812 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  27.27 
 
 		 223 aa  42  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  24.68 
 
 		 211 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>