268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1526 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1526  GDSL family lipase  100 
 
 
206 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0224358  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  34.62 
 
 
204 aa  135  4e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2112  lipolytic protein G-D-S-L family  34.86 
 
 
218 aa  114  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.835545 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  37.43 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  34.05 
 
 
202 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2149  putative lipase  37.35 
 
 
203 aa  105  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.208079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1745  GDSL family lipase  35.09 
 
 
242 aa  98.2  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0864047  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  31.69 
 
 
216 aa  96.7  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  33.33 
 
 
266 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0488  GDSL family lipase  33.54 
 
 
203 aa  95.9  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307636  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0057  lipolytic protein G-D-S-L family  32.35 
 
 
212 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3558  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.22 
 
 
201 aa  93.2  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0285978  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1278  GDSL family lipase  33.82 
 
 
223 aa  92.8  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398687  normal  0.0389661 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  32.54 
 
 
189 aa  92  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2630  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.14 
 
 
198 aa  91.3  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0895129  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2989  GDSL family lipase  31.07 
 
 
203 aa  89  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.816827  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  29.81 
 
 
219 aa  87.4  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3205  GDSL family lipase  32.52 
 
 
201 aa  87.8  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765552  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3734  GDSL family lipase  32.04 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00414819  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.61 
 
 
270 aa  87.8  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  31.67 
 
 
223 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  29.89 
 
 
219 aa  86.3  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  31.74 
 
 
270 aa  85.9  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  34.73 
 
 
257 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1152  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.87 
 
 
227 aa  84.7  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  32.26 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  29.23 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  31.61 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2959  arylesterase  30.77 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  30.16 
 
 
212 aa  82  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  33.14 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  30.99 
 
 
213 aa  82  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  33.71 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  30.41 
 
 
214 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  31.18 
 
 
195 aa  80.9  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1973  arylesterase  30.34 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1250  arylesterase  28.02 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2620  arylesterase  31.84 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403084  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  30.43 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3159  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  30.9 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.681628  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2368  arylesterase  33.71 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  30.94 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1271  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  30.9 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.934354  normal  0.745866 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3021  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  30.9 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.116917  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  31.98 
 
 
226 aa  79  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0285  arylesterase precursor  30.94 
 
 
206 aa  79  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  28.91 
 
 
255 aa  79  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1401  arylesterase  28.88 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2914  arylesterase  31.28 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  31.79 
 
 
240 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  30.39 
 
 
252 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0968  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  30.11 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  30 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  30 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0549  arylesterase  27.72 
 
 
219 aa  77.8  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.65296  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  30.81 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2409  arylesterase  31.84 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170275 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  32.14 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  29.89 
 
 
216 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1599  lipolytic protein G-D-S-L family  29.03 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  30.12 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1122  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  29.06 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0118083  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0615  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  28.09 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.382556  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0571  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  28.09 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0554  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  28.09 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0561  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  28.09 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.868884  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  29.21 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0556  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  28.09 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  29.12 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  31.93 
 
 
195 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1157  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  29.05 
 
 
196 aa  74.7  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.987019  hitchhiker  0.000093812 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0651  Lysophospholipase  27.78 
 
 
214 aa  74.7  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.623159  normal  0.969568 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3193  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  29.05 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.194164  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  29.78 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  29.78 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0598  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  27.84 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.79584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6500  lipolytic protein G-D-S-L family  26.84 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1660  arylesterase  31.46 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00445  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  27.84 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3116  Lysophospholipase  27.84 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0429  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  27.84 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3122  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  27.84 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0543  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  27.84 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00450  hypothetical protein  27.84 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0574  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  27.84 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04660  acyl-CoA thioesterase I  31.28 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0171424  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0533  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  27.84 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1017  lysophospholipase  29.57 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3020  GDSL family lipase  28.73 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.242695 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  30.39 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1044  arylesterase  29.78 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6160  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.9 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.77 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  28.49 
 
 
214 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1603  lipolytic protein G-D-S-L family  29.83 
 
 
215 aa  72  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1919  GDSL family lipase  30.9 
 
 
222 aa  72  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2271  GDSL family lipase  29.83 
 
 
215 aa  72  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.806059  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  29.61 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  29.61 
 
 
218 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1942  GDSL family lipase  29.06 
 
 
222 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>