106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3985 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3985  GDSL family lipase  100 
 
 
298 aa  568  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0334981  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  46.25 
 
 
329 aa  196  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  52.54 
 
 
343 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0643  lipolytic protein G-D-S-L family  49.38 
 
 
376 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  46.26 
 
 
324 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0910  GDSL family lipase  50.43 
 
 
361 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0938  GDSL family lipase  45.2 
 
 
348 aa  175  7e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0082  lipolytic protein G-D-S-L family  46.94 
 
 
351 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0853  GDSL family lipase  52.17 
 
 
361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  43.62 
 
 
305 aa  165  8e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  43.69 
 
 
368 aa  159  7e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0930  lipolytic protein G-D-S-L family  48.29 
 
 
340 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0437  putative secreted protein  46.53 
 
 
347 aa  153  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1616  lipolytic protein G-D-S-L family  43.82 
 
 
305 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11093  hypothetical protein  41.04 
 
 
314 aa  144  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.963411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4151  lipolytic enzyme, G-D-S-L  41.44 
 
 
318 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4226  GDSL family lipase  41.44 
 
 
318 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.558892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4382  GDSL family lipase  41.06 
 
 
318 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4676  GDSL family lipase  41.94 
 
 
320 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.694492 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2041  GDSL family lipase  39.92 
 
 
320 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23917  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4423  lipolytic protein G-D-S-L family  41.41 
 
 
348 aa  132  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0909  GDSL family lipase  44.56 
 
 
270 aa  119  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0852  GDSL family lipase  45.6 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3837  lipolytic protein G-D-S-L family  42.78 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.490417  normal  0.0238456 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2140  lipolytic protein G-D-S-L family  42.79 
 
 
207 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0498  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.33 
 
 
238 aa  75.5  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1853  GDSL family lipase  29.85 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211701 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3405  lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  32.02 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3000  hypothetical protein  39.01 
 
 
267 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0124  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  39.01 
 
 
267 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3305  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  39.01 
 
 
244 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3921  lipolytic enzyme, G-D-S-L  39.34 
 
 
244 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3993  lipolytic enzyme, G-D-S-L  39.01 
 
 
244 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3065  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  39.34 
 
 
244 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21100  lysophospholipase L1-like esterase  32.49 
 
 
223 aa  63.9  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2206  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.06 
 
 
280 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0148894  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3258  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  37.36 
 
 
258 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  29.44 
 
 
219 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0136  hypothetical protein  37.16 
 
 
240 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3142  hypothetical protein  28.11 
 
 
237 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.917118  normal  0.0747759 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1915  hypothetical protein  26.61 
 
 
280 aa  57  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000228464  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0149  hypothetical protein  35.05 
 
 
235 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0148  hypothetical protein  33.52 
 
 
240 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01055  hypothetical protein  32.12 
 
 
217 aa  55.8  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.411202  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0162  hypothetical protein  35.16 
 
 
235 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3328  hypothetical protein  35.16 
 
 
235 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2906  hypothetical protein  35.05 
 
 
235 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  33.33 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4028  hypothetical protein  34.16 
 
 
280 aa  53.1  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012375 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2866  hypothetical protein  28.3 
 
 
242 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4035  arylesterase  27.55 
 
 
214 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0926755 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2308  GDSL family lipase/acylhydrolase  27.37 
 
 
206 aa  50.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85334  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1908  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.5 
 
 
267 aa  50.8  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000035223  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1745  GDSL family lipase  27.72 
 
 
242 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0864047  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0156  lipolytic protein G-D-S-L family  29.46 
 
 
256 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0132621  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.13 
 
 
270 aa  49.7  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2127  GDSL family lipase  25.38 
 
 
246 aa  49.3  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169473  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  30.69 
 
 
244 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3261  hypothetical protein  32.87 
 
 
250 aa  49.3  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5099  lipase/acylhydrolase  23.45 
 
 
269 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  28.72 
 
 
189 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5194  GDSL family lipase  24.19 
 
 
269 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  20.21 
 
 
196 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  20.21 
 
 
196 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2484  lipolytic protein G-D-S-L family  26.44 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5530  lipase/acylhydrolase, putative  23.45 
 
 
269 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5253  lipase/acylhydrolase  23.45 
 
 
269 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5082  lipase/acylhydrolase  23.45 
 
 
269 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000543615  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  25.13 
 
 
270 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5651  lipase/acylhydrolase  23.45 
 
 
269 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  26.37 
 
 
266 aa  47  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5496  putative lipase/acylhydrolase  23.45 
 
 
269 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  37.04 
 
 
749 aa  47  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2616  GDSL family lipase  29.13 
 
 
225 aa  47  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5524  putative lipase/acylhydrolase  23.01 
 
 
269 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120317  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34730  lysophospholipase L1-like esterase  29.17 
 
 
302 aa  47  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0437206  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1326  GDSL family lipase  28.14 
 
 
287 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  20.21 
 
 
197 aa  46.6  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0068  lipolytic protein  31.65 
 
 
247 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523857  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0072  GDSL family lipase  29.35 
 
 
294 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2271  GDSL family lipase  28.3 
 
 
215 aa  46.2  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.806059  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1363  lipolytic protein G-D-S-L family  28.24 
 
 
289 aa  46.6  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1603  lipolytic protein G-D-S-L family  28.3 
 
 
215 aa  46.2  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.15 
 
 
270 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2055  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  26.87 
 
 
264 aa  45.8  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  20.42 
 
 
197 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  29.1 
 
 
204 aa  45.8  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  19.9 
 
 
211 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  19.9 
 
 
211 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15910  hypothetical protein  33.33 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.165827 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3922  GDSL family lipase  23.56 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5580  putative lipase/acylhydrolase  23.01 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0855  hypothetical protein  29.23 
 
 
267 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  19.9 
 
 
197 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  27.47 
 
 
204 aa  45.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  31.4 
 
 
249 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  19.9 
 
 
197 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2409  arylesterase  28.21 
 
 
204 aa  43.9  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1368  hypothetical protein  30.37 
 
 
249 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  25.13 
 
 
216 aa  44.3  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>