91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0072 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0072  GDSL family lipase  100 
 
 
294 aa  584  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  65.62 
 
 
296 aa  343  2e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1326  GDSL family lipase  62.98 
 
 
287 aa  335  7e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1363  lipolytic protein G-D-S-L family  60.97 
 
 
289 aa  323  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0263  lipolytic protein G-D-S-L family  61.24 
 
 
301 aa  322  5e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06060  lysophospholipase L1-like esterase  50 
 
 
297 aa  255  5e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105705  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19770  lysophospholipase L1-like esterase  48.41 
 
 
255 aa  238  5.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  hitchhiker  0.000837214 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4413  GDSL family lipase  45.77 
 
 
266 aa  206  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3727  lipolytic protein G-D-S-L family  48.47 
 
 
257 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0855  hypothetical protein  47.24 
 
 
267 aa  203  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335493  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2206  lipolytic protein G-D-S-L family  45.25 
 
 
261 aa  198  7e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.235445 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3925  GDSL family lipase  47.44 
 
 
253 aa  196  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3930  GDSL family lipase  44.03 
 
 
283 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34730  lysophospholipase L1-like esterase  43.43 
 
 
302 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0437206  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1065  lipolytic protein G-D-S-L family  43.72 
 
 
258 aa  193  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0731  lipolytic protein G-D-S-L family  43.28 
 
 
265 aa  192  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0386  lipolytic protein G-D-S-L family  42.91 
 
 
258 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0732  lipolytic protein G-D-S-L family  46.3 
 
 
263 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1490  lipolytic protein G-D-S-L family  55.31 
 
 
264 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2060  lipolytic protein G-D-S-L family  43.13 
 
 
281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6531  hypothetical protein  41.29 
 
 
262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.0269756 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3730  lipolytic protein G-D-S-L family  47.96 
 
 
281 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5121  GDSL family lipase  42.74 
 
 
254 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245752  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  46.34 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31650  lysophospholipase L1-like esterase  40.3 
 
 
326 aa  172  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0023  GDSL family lipase  42.52 
 
 
259 aa  170  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0027  GDSL family lipase  42.13 
 
 
255 aa  169  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  39.37 
 
 
258 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  41.5 
 
 
300 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0811  lipolytic protein G-D-S-L family  38.71 
 
 
333 aa  162  8.000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.0157392 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0684  lipolytic protein G-D-S-L family  40.51 
 
 
273 aa  161  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0974788  hitchhiker  0.0000166957 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2945  lipolytic protein G-D-S-L family  41.57 
 
 
289 aa  160  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2954  lipolytic protein G-D-S-L family  44.65 
 
 
319 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23280  lysophospholipase L1-like esterase  40.47 
 
 
290 aa  154  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  39.78 
 
 
270 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2275  lipolytic protein G-D-S-L family  41.76 
 
 
278 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21860  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  38.28 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00185801  normal  0.684974 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0254  lipolytic protein G-D-S-L family  36.33 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3065  lipolytic protein G-D-S-L family  36.9 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3183  GDSL family lipase  35.41 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209984 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2884  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.18 
 
 
258 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0469503  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2928  GDSL family lipase  35.18 
 
 
256 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2914  GDSL family lipase  35.18 
 
 
256 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  29.95 
 
 
196 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0156  lipolytic protein G-D-S-L family  33.33 
 
 
256 aa  99.8  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0132621  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  29.29 
 
 
196 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  29.44 
 
 
197 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  29.15 
 
 
211 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  29.15 
 
 
211 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  34.21 
 
 
210 aa  93.6  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  28.79 
 
 
197 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  28.93 
 
 
197 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  28.93 
 
 
197 aa  92.4  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2484  GDSL family lipase  33.51 
 
 
234 aa  90.5  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2667  GDSL family lipase  35.71 
 
 
234 aa  90.5  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24646  hitchhiker  0.000175501 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  28.22 
 
 
197 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2321  lipase/acylhydrolase  34.43 
 
 
143 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183981  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3278  hypothetical protein  29.57 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3268  lipolytic protein G-D-S-L family  35.09 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.87 
 
 
270 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2933  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.53 
 
 
218 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.594206  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1589  lipolytic protein G-D-S-L family  25.97 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0691726  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3955  GDSL family lipase  33.51 
 
 
218 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00727916  normal  0.035201 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  29.91 
 
 
368 aa  53.1  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  29.95 
 
 
244 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0409  lipolytic protein G-D-S-L family  27.75 
 
 
242 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.252597  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3922  GDSL family lipase  41.38 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0503  lipase/acylhydrolase  37.36 
 
 
279 aa  47.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  28.87 
 
 
324 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5524  putative lipase/acylhydrolase  39.08 
 
 
269 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5580  putative lipase/acylhydrolase  39.08 
 
 
269 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5530  lipase/acylhydrolase, putative  39.08 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5253  lipase/acylhydrolase  39.08 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5496  putative lipase/acylhydrolase  39.08 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5082  lipase/acylhydrolase  39.08 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000543615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5099  lipase/acylhydrolase  39.08 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5651  lipase/acylhydrolase  39.08 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  29.1 
 
 
249 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5194  GDSL family lipase  39.08 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1812  lipolytic protein G-D-S-L family  26.27 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000302668  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.99 
 
 
329 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  29.71 
 
 
322 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1774  lipolytic protein G-D-S-L family  28.64 
 
 
229 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0086  lipolytic protein G-D-S-L family  29.1 
 
 
240 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  27.52 
 
 
379 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2484  lipolytic protein G-D-S-L family  36.73 
 
 
265 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0910  GDSL family lipase  30.73 
 
 
361 aa  43.5  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5427  putative lipase/acylhydrolase  37.93 
 
 
269 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.387496  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  23.41 
 
 
225 aa  42.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0761  lysophospholipase L1 related esterase  31.76 
 
 
303 aa  42.4  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6375  lipolytic protein  28.8 
 
 
454 aa  42.4  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>