87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0930 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0930  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
340 aa  643    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  54.61 
 
 
324 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0910  GDSL family lipase  57.39 
 
 
361 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  56.83 
 
 
343 aa  266  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0853  GDSL family lipase  55.49 
 
 
361 aa  266  5e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  52.33 
 
 
329 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0938  GDSL family lipase  54.24 
 
 
348 aa  258  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0643  lipolytic protein G-D-S-L family  52.56 
 
 
376 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0082  lipolytic protein G-D-S-L family  49.69 
 
 
351 aa  212  7.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0437  putative secreted protein  46.73 
 
 
347 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  47.56 
 
 
305 aa  186  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  44.35 
 
 
368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1616  lipolytic protein G-D-S-L family  44.35 
 
 
305 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3985  GDSL family lipase  48.16 
 
 
298 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0334981  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4226  GDSL family lipase  44.32 
 
 
318 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.558892  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4151  lipolytic enzyme, G-D-S-L  44.32 
 
 
318 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4423  lipolytic protein G-D-S-L family  37.84 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4382  GDSL family lipase  43.94 
 
 
318 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2041  GDSL family lipase  43.2 
 
 
320 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23917  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4676  GDSL family lipase  44.4 
 
 
320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.694492 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11093  hypothetical protein  42.86 
 
 
314 aa  139  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.963411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0909  GDSL family lipase  49.75 
 
 
270 aa  133  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0852  GDSL family lipase  49.24 
 
 
270 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3837  lipolytic protein G-D-S-L family  41.36 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.490417  normal  0.0238456 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2140  lipolytic protein G-D-S-L family  37.77 
 
 
207 aa  62.8  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  29 
 
 
219 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  22.96 
 
 
196 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  23.44 
 
 
196 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  27.07 
 
 
270 aa  57.8  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3405  lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  31.18 
 
 
244 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  31.91 
 
 
270 aa  56.6  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.07 
 
 
270 aa  56.2  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1853  GDSL family lipase  27.8 
 
 
263 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211701 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  35.78 
 
 
249 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  34.62 
 
 
244 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0086  lipolytic protein G-D-S-L family  35.78 
 
 
240 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  20.53 
 
 
211 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06060  lysophospholipase L1-like esterase  31.06 
 
 
297 aa  52.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105705  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3183  GDSL family lipase  34.44 
 
 
256 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209984 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1812  lipolytic protein G-D-S-L family  25.89 
 
 
264 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000302668  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  20.53 
 
 
197 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3258  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  31.28 
 
 
258 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  21.54 
 
 
211 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3261  hypothetical protein  29.14 
 
 
250 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  20.53 
 
 
197 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  20.53 
 
 
197 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  26.2 
 
 
266 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0027  GDSL family lipase  31.47 
 
 
255 aa  50.1  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3305  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  31.39 
 
 
244 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3993  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.39 
 
 
244 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0124  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  31.39 
 
 
267 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.75 
 
 
270 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3065  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  31.39 
 
 
244 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  26.26 
 
 
216 aa  49.3  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2616  GDSL family lipase  29.33 
 
 
225 aa  49.3  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3921  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.39 
 
 
244 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619523  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3000  hypothetical protein  31.39 
 
 
267 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0068  lipolytic protein  34.16 
 
 
247 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523857  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  35.77 
 
 
296 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4413  GDSL family lipase  32.68 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  20.51 
 
 
197 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2866  hypothetical protein  26.29 
 
 
242 aa  47.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0149  hypothetical protein  31.7 
 
 
235 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21100  lysophospholipase L1-like esterase  29.17 
 
 
223 aa  47.4  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  21.35 
 
 
197 aa  47  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  24.87 
 
 
204 aa  46.2  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2906  hypothetical protein  31.7 
 
 
235 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0162  hypothetical protein  31.7 
 
 
235 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  31.45 
 
 
300 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0503  lipase/acylhydrolase  23.95 
 
 
279 aa  45.8  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1368  hypothetical protein  29.73 
 
 
249 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0156  lipolytic protein G-D-S-L family  31.75 
 
 
256 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0132621  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2954  lipolytic protein G-D-S-L family  27.92 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0072  GDSL family lipase  28.43 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0498  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.59 
 
 
238 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  27.98 
 
 
210 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1526  GDSL family lipase  24.59 
 
 
206 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0224358  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0136  hypothetical protein  31.56 
 
 
240 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1908  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.09 
 
 
267 aa  43.5  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000035223  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2484  lipolytic protein G-D-S-L family  25.09 
 
 
265 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0148  hypothetical protein  31.56 
 
 
240 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4028  hypothetical protein  32.64 
 
 
280 aa  43.1  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012375 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3142  hypothetical protein  27.68 
 
 
237 aa  43.1  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.917118  normal  0.0747759 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0023  GDSL family lipase  28.28 
 
 
259 aa  43.1  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3930  GDSL family lipase  28.22 
 
 
283 aa  43.1  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  26.79 
 
 
213 aa  42.4  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0855  hypothetical protein  31.03 
 
 
267 aa  42.4  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>