86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0023 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0023  GDSL family lipase  100 
 
 		 259 aa  517  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0027  GDSL family lipase  90.59 
 
 		 255 aa  474  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  53.36 
 
 		 258 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34730  lysophospholipase L1-like esterase  45.1 
 
 		 302 aa  217  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0437206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0855  hypothetical protein  47.47 
 
 		 267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335493  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2275  lipolytic protein G-D-S-L family  48.41 
 
 		 278 aa  215  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0731  lipolytic protein G-D-S-L family  47.43 
 
 		 265 aa  209  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2206  lipolytic protein G-D-S-L family  46.77 
 
 		 261 aa  209  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.235445 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1363  lipolytic protein G-D-S-L family  44.92 
 
 		 289 aa  206  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  47.76 
 
 		 260 aa  204  9e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6531  hypothetical protein  46.33 
 
 		 262 aa  201  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.0269756 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1326  GDSL family lipase  44.09 
 
 		 287 aa  199  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06060  lysophospholipase L1-like esterase  46.88 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105705  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0732  lipolytic protein G-D-S-L family  45.1 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0386  lipolytic protein G-D-S-L family  43.24 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2060  lipolytic protein G-D-S-L family  44.02 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19770  lysophospholipase L1-like esterase  46.67 
 
 		 255 aa  188  7e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  hitchhiker  0.000837214 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4413  GDSL family lipase  46.85 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1490  lipolytic protein G-D-S-L family  48.19 
 
 		 264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0263  lipolytic protein G-D-S-L family  41.41 
 
 		 301 aa  178  5.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0254  lipolytic protein G-D-S-L family  41.04 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0684  lipolytic protein G-D-S-L family  44.79 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0974788  hitchhiker  0.0000166957 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  41.38 
 
 		 296 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3065  lipolytic protein G-D-S-L family  43.2 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0811  lipolytic protein G-D-S-L family  43.58 
 
 		 333 aa  174  9e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.0157392 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3727  lipolytic protein G-D-S-L family  43.24 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31650  lysophospholipase L1-like esterase  42.25 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  41.9 
 
 		 300 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0072  GDSL family lipase  42.52 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1065  lipolytic protein G-D-S-L family  39.62 
 
 		 258 aa  166  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3925  GDSL family lipase  40.54 
 
 		 253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  41.37 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23280  lysophospholipase L1-like esterase  39.78 
 
 		 290 aa  158  8e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3930  GDSL family lipase  40.86 
 
 		 283 aa  157  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2954  lipolytic protein G-D-S-L family  42.86 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3730  lipolytic protein G-D-S-L family  41.47 
 
 		 281 aa  152  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2945  lipolytic protein G-D-S-L family  40 
 
 		 289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2884  lipolytic enzyme, G-D-S-L  40.08 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0469503  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21860  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  39.05 
 
 		 307 aa  149  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00185801  normal  0.684974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2914  GDSL family lipase  40 
 
 		 256 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2928  GDSL family lipase  40 
 
 		 256 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5121  GDSL family lipase  38.37 
 
 		 254 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245752  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3183  GDSL family lipase  39.53 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209984 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  28.06 
 
 		 196 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  27.55 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  34.21 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  27.45 
 
 		 211 aa  97.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  28.21 
 
 		 197 aa  97.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  28 
 
 		 197 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  27.5 
 
 		 197 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  27.5 
 
 		 197 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  27.14 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  28.72 
 
 		 197 aa  92  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0156  lipolytic protein G-D-S-L family  32.12 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0132621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.96 
 
 		 270 aa  85.5  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2933  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.07 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.594206  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3278  hypothetical protein  26.37 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2321  lipase/acylhydrolase  33.59 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183981  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2484  GDSL family lipase  33.16 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2667  GDSL family lipase  31.63 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24646  hitchhiker  0.000175501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2237  GDSL family lipase  30.89 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0161232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3955  GDSL family lipase  30.27 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00727916  normal  0.035201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3268  lipolytic protein G-D-S-L family  30.1 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  29.69 
 
 		 219 aa  52  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  32.07 
 
 		 343 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  29.8 
 
 		 368 aa  48.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0796  hypothetical protein  38.33 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2898  arylesterase  22.94 
 
 		 190 aa  46.2  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179811  hitchhiker  0.000609296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  28 
 
 		 324 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  24.86 
 
 		 286 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  24.86 
 
 		 275 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1812  lipolytic protein G-D-S-L family  24.14 
 
 		 264 aa  45.4  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000302668  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  28.38 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  24.32 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2688  arylesterase  24.46 
 
 		 199 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2785  arylesterase  24.46 
 
 		 185 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.761375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2484  lipolytic protein G-D-S-L family  24.77 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  29.89 
 
 		 201 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1678  Arylesterase  24.46 
 
 		 185 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740826  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2709  arylesterase  24.46 
 
 		 216 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1543  arylesterase  24.24 
 
 		 199 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1478  arylesterase  24.24 
 
 		 199 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2456  lipolytic protein G-D-S-L family  30 
 
 		 219 aa  42  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00970732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2742  two component transcriptional regulator, winged helix family  23.57 
 
 		 230 aa  42  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1537  GDSL family lipase  24.24 
 
 		 199 aa  42  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131898 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2673  lipolytic protein G-D-S-L family  25.6 
 
 		 227 aa  42  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.12388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>