76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3925 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3925  GDSL family lipase  100 
 
 
253 aa  513  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3727  lipolytic protein G-D-S-L family  86.17 
 
 
257 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1065  lipolytic protein G-D-S-L family  56.75 
 
 
258 aa  285  5.999999999999999e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4413  GDSL family lipase  56.91 
 
 
266 aa  279  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19770  lysophospholipase L1-like esterase  55.87 
 
 
255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  hitchhiker  0.000837214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3930  GDSL family lipase  48.39 
 
 
283 aa  235  4e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3730  lipolytic protein G-D-S-L family  47.77 
 
 
281 aa  225  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1363  lipolytic protein G-D-S-L family  47.9 
 
 
289 aa  224  9e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1326  GDSL family lipase  47.48 
 
 
287 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5121  GDSL family lipase  46.37 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245752  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  47.3 
 
 
296 aa  209  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06060  lysophospholipase L1-like esterase  47.11 
 
 
297 aa  206  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105705  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31650  lysophospholipase L1-like esterase  43.7 
 
 
326 aa  204  8e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0855  hypothetical protein  45.49 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335493  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  48.75 
 
 
260 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0072  GDSL family lipase  47.44 
 
 
294 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6531  hypothetical protein  44.53 
 
 
262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.0269756 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0684  lipolytic protein G-D-S-L family  43.36 
 
 
273 aa  195  6e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0974788  hitchhiker  0.0000166957 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0263  lipolytic protein G-D-S-L family  42.79 
 
 
301 aa  194  9e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2206  lipolytic protein G-D-S-L family  42.25 
 
 
261 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.235445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0386  lipolytic protein G-D-S-L family  42.51 
 
 
258 aa  191  8e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1490  lipolytic protein G-D-S-L family  46.44 
 
 
264 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2060  lipolytic protein G-D-S-L family  43.25 
 
 
281 aa  188  5.999999999999999e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0732  lipolytic protein G-D-S-L family  45.49 
 
 
263 aa  186  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0811  lipolytic protein G-D-S-L family  39.45 
 
 
333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.0157392 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2945  lipolytic protein G-D-S-L family  41.73 
 
 
289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  41.04 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34730  lysophospholipase L1-like esterase  42.57 
 
 
302 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0437206  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21860  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  42.01 
 
 
307 aa  183  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00185801  normal  0.684974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  43.09 
 
 
258 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0731  lipolytic protein G-D-S-L family  42.97 
 
 
265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2954  lipolytic protein G-D-S-L family  42.06 
 
 
319 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0023  GDSL family lipase  40.54 
 
 
259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2275  lipolytic protein G-D-S-L family  41.18 
 
 
278 aa  165  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23280  lysophospholipase L1-like esterase  37.55 
 
 
290 aa  159  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0027  GDSL family lipase  38.61 
 
 
255 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  40.16 
 
 
270 aa  156  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0254  lipolytic protein G-D-S-L family  40.66 
 
 
254 aa  148  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3065  lipolytic protein G-D-S-L family  37.76 
 
 
262 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2914  GDSL family lipase  35.6 
 
 
256 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2928  GDSL family lipase  35.6 
 
 
256 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2884  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.92 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0469503  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3183  GDSL family lipase  34.24 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209984 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  34.16 
 
 
210 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  30.73 
 
 
196 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  29.69 
 
 
196 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  30.3 
 
 
197 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  30.3 
 
 
197 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  29.8 
 
 
197 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  29.8 
 
 
197 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  29.8 
 
 
211 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  29.8 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  28.65 
 
 
197 aa  88.6  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0156  lipolytic protein G-D-S-L family  29.55 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0132621  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2667  GDSL family lipase  31.47 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24646  hitchhiker  0.000175501 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2484  GDSL family lipase  30.93 
 
 
234 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3278  hypothetical protein  26.92 
 
 
229 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2933  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.87 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.594206  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.2 
 
 
270 aa  72  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2321  lipase/acylhydrolase  36.61 
 
 
143 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3268  lipolytic protein G-D-S-L family  36.44 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3955  GDSL family lipase  30.26 
 
 
218 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00727916  normal  0.035201 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0553  lipolytic protein G-D-S-L family  25.94 
 
 
214 aa  53.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  26.79 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2692  lipolytic protein G-D-S-L family  28.3 
 
 
217 aa  48.5  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2237  GDSL family lipase  32.5 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0161232 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19520  lysophospholipase L1-like esterase  26.56 
 
 
209 aa  46.6  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.347124  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  24.5 
 
 
266 aa  45.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  25.95 
 
 
244 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  24.64 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  26.06 
 
 
286 aa  43.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  26.06 
 
 
275 aa  42.7  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0665  hypothetical protein  26.95 
 
 
333 aa  42.4  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  25.5 
 
 
234 aa  42.4  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7234  lipolytic protein G-D-S-L family  33.72 
 
 
270 aa  42  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2499  lipolytic protein G-D-S-L family  35.48 
 
 
272 aa  42.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>