72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1065 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1065  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
258 aa  518  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3925  GDSL family lipase  56.75 
 
 
253 aa  285  5.999999999999999e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3727  lipolytic protein G-D-S-L family  53.97 
 
 
257 aa  280  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4413  GDSL family lipase  51.82 
 
 
266 aa  259  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19770  lysophospholipase L1-like esterase  51.01 
 
 
255 aa  248  7e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  hitchhiker  0.000837214 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1363  lipolytic protein G-D-S-L family  47.15 
 
 
289 aa  227  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1326  GDSL family lipase  46.75 
 
 
287 aa  223  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3930  GDSL family lipase  44.35 
 
 
283 aa  222  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06060  lysophospholipase L1-like esterase  47.18 
 
 
297 aa  217  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105705  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3730  lipolytic protein G-D-S-L family  45.45 
 
 
281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  44.9 
 
 
296 aa  206  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2206  lipolytic protein G-D-S-L family  41.54 
 
 
261 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.235445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34730  lysophospholipase L1-like esterase  43.31 
 
 
302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0437206  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0263  lipolytic protein G-D-S-L family  39.32 
 
 
301 aa  199  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5121  GDSL family lipase  42.13 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245752  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6531  hypothetical protein  43.8 
 
 
262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.0269756 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0072  GDSL family lipase  43.72 
 
 
294 aa  193  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0386  lipolytic protein G-D-S-L family  41.96 
 
 
258 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0855  hypothetical protein  42.86 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335493  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0732  lipolytic protein G-D-S-L family  43.03 
 
 
263 aa  188  9e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  41.44 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0731  lipolytic protein G-D-S-L family  44.31 
 
 
265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0684  lipolytic protein G-D-S-L family  41.38 
 
 
273 aa  183  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0974788  hitchhiker  0.0000166957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1490  lipolytic protein G-D-S-L family  43.03 
 
 
264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  42.86 
 
 
260 aa  179  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  42.97 
 
 
258 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31650  lysophospholipase L1-like esterase  40 
 
 
326 aa  172  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2060  lipolytic protein G-D-S-L family  39.06 
 
 
281 aa  169  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0023  GDSL family lipase  39.62 
 
 
259 aa  166  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0027  GDSL family lipase  40 
 
 
255 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2954  lipolytic protein G-D-S-L family  40.73 
 
 
319 aa  165  8e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2945  lipolytic protein G-D-S-L family  36.7 
 
 
289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  41.11 
 
 
270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23280  lysophospholipase L1-like esterase  38.87 
 
 
290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0811  lipolytic protein G-D-S-L family  37.33 
 
 
333 aa  162  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.0157392 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21860  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  39.42 
 
 
307 aa  160  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00185801  normal  0.684974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2275  lipolytic protein G-D-S-L family  38.8 
 
 
278 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2928  GDSL family lipase  35.97 
 
 
256 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2914  GDSL family lipase  35.97 
 
 
256 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0254  lipolytic protein G-D-S-L family  38.46 
 
 
254 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2884  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.57 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0469503  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3065  lipolytic protein G-D-S-L family  37.6 
 
 
262 aa  131  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3183  GDSL family lipase  35.94 
 
 
256 aa  129  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209984 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  32.64 
 
 
210 aa  96.3  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  30.1 
 
 
196 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  30.61 
 
 
196 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  30.48 
 
 
197 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  30.15 
 
 
197 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  30.15 
 
 
197 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  30.15 
 
 
197 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  30.15 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  29.65 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0156  lipolytic protein G-D-S-L family  29.23 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0132621  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  28.57 
 
 
197 aa  82  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2484  GDSL family lipase  35.1 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2933  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.32 
 
 
218 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.594206  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3278  hypothetical protein  28.42 
 
 
229 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2667  GDSL family lipase  35.4 
 
 
234 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24646  hitchhiker  0.000175501 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2321  lipase/acylhydrolase  37.72 
 
 
143 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3268  lipolytic protein G-D-S-L family  41.38 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3955  GDSL family lipase  30.73 
 
 
218 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00727916  normal  0.035201 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.39 
 
 
270 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  25.49 
 
 
225 aa  52.4  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  27.67 
 
 
244 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2237  GDSL family lipase  35.35 
 
 
284 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0161232 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  29.66 
 
 
249 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  26.57 
 
 
266 aa  43.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1774  lipolytic protein G-D-S-L family  36.67 
 
 
229 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0086  lipolytic protein G-D-S-L family  28.57 
 
 
240 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3904  lipolytic protein  30.56 
 
 
216 aa  42.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0761  lysophospholipase L1 related esterase  30 
 
 
303 aa  42  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0553  lipolytic protein G-D-S-L family  24.63 
 
 
214 aa  42  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>