69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3065 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3065  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
262 aa  521  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0254  lipolytic protein G-D-S-L family  55.83 
 
 
254 aa  256  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0023  GDSL family lipase  43.2 
 
 
259 aa  176  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0027  GDSL family lipase  43.03 
 
 
255 aa  170  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  40.87 
 
 
260 aa  166  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  38.52 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4413  GDSL family lipase  42.98 
 
 
266 aa  162  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19770  lysophospholipase L1-like esterase  40.24 
 
 
255 aa  155  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  hitchhiker  0.000837214 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34730  lysophospholipase L1-like esterase  36.22 
 
 
302 aa  154  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0437206  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2275  lipolytic protein G-D-S-L family  38.84 
 
 
278 aa  151  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1363  lipolytic protein G-D-S-L family  38.34 
 
 
289 aa  150  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0855  hypothetical protein  37.35 
 
 
267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335493  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06060  lysophospholipase L1-like esterase  39.29 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105705  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0731  lipolytic protein G-D-S-L family  38.87 
 
 
265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0684  lipolytic protein G-D-S-L family  39.78 
 
 
273 aa  145  8.000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0974788  hitchhiker  0.0000166957 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3925  GDSL family lipase  37.76 
 
 
253 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2206  lipolytic protein G-D-S-L family  37.45 
 
 
261 aa  142  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.235445 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1326  GDSL family lipase  37.8 
 
 
287 aa  142  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3727  lipolytic protein G-D-S-L family  36.99 
 
 
257 aa  142  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  36.11 
 
 
300 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2060  lipolytic protein G-D-S-L family  35.94 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0732  lipolytic protein G-D-S-L family  36.55 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0386  lipolytic protein G-D-S-L family  34.82 
 
 
258 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3930  GDSL family lipase  38.4 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1490  lipolytic protein G-D-S-L family  39 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1065  lipolytic protein G-D-S-L family  37.6 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2954  lipolytic protein G-D-S-L family  36.55 
 
 
319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2945  lipolytic protein G-D-S-L family  34.56 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31650  lysophospholipase L1-like esterase  35.34 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0072  GDSL family lipase  36.9 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6531  hypothetical protein  35.22 
 
 
262 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.0269756 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  33.74 
 
 
296 aa  125  9e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0263  lipolytic protein G-D-S-L family  34.48 
 
 
301 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  36.08 
 
 
270 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21860  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  33.7 
 
 
307 aa  122  9e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00185801  normal  0.684974 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23280  lysophospholipase L1-like esterase  35.91 
 
 
290 aa  119  6e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0811  lipolytic protein G-D-S-L family  33.67 
 
 
333 aa  118  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.0157392 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3730  lipolytic protein G-D-S-L family  36.07 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2928  GDSL family lipase  34.13 
 
 
256 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2914  GDSL family lipase  34.13 
 
 
256 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2884  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.13 
 
 
258 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0469503  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  31.25 
 
 
196 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5121  GDSL family lipase  34.32 
 
 
254 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245752  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  30.77 
 
 
197 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  30.57 
 
 
196 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  29.15 
 
 
197 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3183  GDSL family lipase  32.11 
 
 
256 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209984 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  29.23 
 
 
197 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  29.23 
 
 
197 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  29.23 
 
 
197 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  29.23 
 
 
211 aa  97.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  28.72 
 
 
211 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.55 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  30.46 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2321  lipase/acylhydrolase  32 
 
 
143 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183981  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3278  hypothetical protein  26.77 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2667  GDSL family lipase  32.04 
 
 
234 aa  58.9  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24646  hitchhiker  0.000175501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3268  lipolytic protein G-D-S-L family  36.21 
 
 
232 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2484  GDSL family lipase  30.88 
 
 
234 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2484  lipolytic protein G-D-S-L family  27.71 
 
 
265 aa  55.8  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0156  lipolytic protein G-D-S-L family  24.31 
 
 
256 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0132621  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2237  GDSL family lipase  37.23 
 
 
284 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0161232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3955  GDSL family lipase  29.59 
 
 
218 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00727916  normal  0.035201 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  27.49 
 
 
368 aa  48.9  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1812  lipolytic protein G-D-S-L family  24.88 
 
 
264 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000302668  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  28.93 
 
 
233 aa  45.8  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2933  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.63 
 
 
218 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.594206  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  26.26 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1589  lipolytic protein G-D-S-L family  25.81 
 
 
264 aa  42.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0691726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>