61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_21860 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_21860  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  100 
 
 
307 aa  610  9.999999999999999e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00185801  normal  0.684974 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31650  lysophospholipase L1-like esterase  49.82 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2060  lipolytic protein G-D-S-L family  46.62 
 
 
281 aa  215  9e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0811  lipolytic protein G-D-S-L family  46.36 
 
 
333 aa  205  7e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.0157392 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0684  lipolytic protein G-D-S-L family  47.78 
 
 
273 aa  204  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0974788  hitchhiker  0.0000166957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1490  lipolytic protein G-D-S-L family  50.76 
 
 
264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2945  lipolytic protein G-D-S-L family  44.88 
 
 
289 aa  193  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23280  lysophospholipase L1-like esterase  46.1 
 
 
290 aa  187  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0386  lipolytic protein G-D-S-L family  41.11 
 
 
258 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3925  GDSL family lipase  42.01 
 
 
253 aa  183  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6531  hypothetical protein  41.43 
 
 
262 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.0269756 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3727  lipolytic protein G-D-S-L family  41.91 
 
 
257 aa  178  8e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34730  lysophospholipase L1-like esterase  39.48 
 
 
302 aa  177  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0437206  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19770  lysophospholipase L1-like esterase  40.37 
 
 
255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  hitchhiker  0.000837214 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0855  hypothetical protein  38.81 
 
 
267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335493  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2206  lipolytic protein G-D-S-L family  37.01 
 
 
261 aa  168  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.235445 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1363  lipolytic protein G-D-S-L family  38.72 
 
 
289 aa  166  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  37.84 
 
 
296 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1326  GDSL family lipase  37.97 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0732  lipolytic protein G-D-S-L family  40.58 
 
 
263 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06060  lysophospholipase L1-like esterase  42.11 
 
 
297 aa  161  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105705  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1065  lipolytic protein G-D-S-L family  39.54 
 
 
258 aa  160  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  37.92 
 
 
260 aa  160  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4413  GDSL family lipase  39.38 
 
 
266 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0731  lipolytic protein G-D-S-L family  37.55 
 
 
265 aa  156  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0263  lipolytic protein G-D-S-L family  39.37 
 
 
301 aa  156  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0023  GDSL family lipase  39.27 
 
 
259 aa  149  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0072  GDSL family lipase  38.28 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  36.65 
 
 
300 aa  146  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2275  lipolytic protein G-D-S-L family  38.01 
 
 
278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0027  GDSL family lipase  36.73 
 
 
255 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  38.6 
 
 
258 aa  139  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2954  lipolytic protein G-D-S-L family  36.33 
 
 
319 aa  136  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0254  lipolytic protein G-D-S-L family  35.38 
 
 
254 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  38.55 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3065  lipolytic protein G-D-S-L family  33.7 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5121  GDSL family lipase  35.85 
 
 
254 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245752  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3730  lipolytic protein G-D-S-L family  33.66 
 
 
281 aa  115  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3930  GDSL family lipase  34.15 
 
 
283 aa  112  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  25.94 
 
 
211 aa  87  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  25.47 
 
 
196 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2914  GDSL family lipase  32.86 
 
 
256 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2884  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.86 
 
 
258 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0469503  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2928  GDSL family lipase  32.86 
 
 
256 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  25.82 
 
 
196 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  25.47 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  25.47 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  25.47 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  25 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  25 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  24.06 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3183  GDSL family lipase  31.44 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209984 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.9 
 
 
270 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3278  hypothetical protein  26.76 
 
 
229 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2321  lipase/acylhydrolase  27.74 
 
 
143 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183981  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  27.09 
 
 
210 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0156  lipolytic protein G-D-S-L family  27.86 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0132621  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2667  GDSL family lipase  27.69 
 
 
234 aa  50.1  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24646  hitchhiker  0.000175501 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2484  GDSL family lipase  27.18 
 
 
234 aa  50.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2933  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.15 
 
 
218 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.594206  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3955  GDSL family lipase  27.45 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00727916  normal  0.035201 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>