76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2237 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2237  GDSL family lipase  100 
 
 
284 aa  541  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0161232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  62.96 
 
 
270 aa  289  3e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  26.92 
 
 
211 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  37.5 
 
 
270 aa  92  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0027  GDSL family lipase  37.4 
 
 
255 aa  91.3  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  27.37 
 
 
211 aa  89.4  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  27.37 
 
 
197 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  27.37 
 
 
197 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  27.37 
 
 
197 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  28.42 
 
 
197 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  27.37 
 
 
197 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3183  GDSL family lipase  35.27 
 
 
256 aa  87  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209984 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  28.42 
 
 
196 aa  87  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0023  GDSL family lipase  34.82 
 
 
259 aa  86.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  27.37 
 
 
196 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2884  lipolytic enzyme, G-D-S-L  38.38 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0469503  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2914  GDSL family lipase  38.38 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2928  GDSL family lipase  38.38 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  34.29 
 
 
210 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2954  lipolytic protein G-D-S-L family  34.17 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3955  GDSL family lipase  34.97 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00727916  normal  0.035201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  33.6 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1490  lipolytic protein G-D-S-L family  39.15 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  32.64 
 
 
260 aa  77  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3065  lipolytic protein G-D-S-L family  30.51 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0731  lipolytic protein G-D-S-L family  33.86 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0263  lipolytic protein G-D-S-L family  31.71 
 
 
301 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0855  hypothetical protein  32.14 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335493  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19770  lysophospholipase L1-like esterase  33.6 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  hitchhiker  0.000837214 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1363  lipolytic protein G-D-S-L family  31.02 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34730  lysophospholipase L1-like esterase  31.15 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0437206  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5121  GDSL family lipase  30.29 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245752  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6531  hypothetical protein  31.37 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.0269756 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  33.01 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2206  lipolytic protein G-D-S-L family  31.22 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.235445 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0254  lipolytic protein G-D-S-L family  32.47 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31650  lysophospholipase L1-like esterase  32.5 
 
 
326 aa  69.3  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2321  lipase/acylhydrolase  31.01 
 
 
143 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183981  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3730  lipolytic protein G-D-S-L family  33.8 
 
 
281 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  34.16 
 
 
296 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0156  lipolytic protein G-D-S-L family  31.71 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0132621  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06060  lysophospholipase L1-like esterase  33.6 
 
 
297 aa  65.5  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105705  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0386  lipolytic protein G-D-S-L family  31.34 
 
 
258 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0732  lipolytic protein G-D-S-L family  31.05 
 
 
263 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1326  GDSL family lipase  28.63 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2945  lipolytic protein G-D-S-L family  32.24 
 
 
289 aa  63.9  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3930  GDSL family lipase  32.52 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0684  lipolytic protein G-D-S-L family  30.3 
 
 
273 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0974788  hitchhiker  0.0000166957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2933  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.15 
 
 
218 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.594206  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3727  lipolytic protein G-D-S-L family  30.29 
 
 
257 aa  60.1  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4413  GDSL family lipase  32.78 
 
 
266 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21860  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  29.67 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00185801  normal  0.684974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2275  lipolytic protein G-D-S-L family  29.58 
 
 
278 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  33.17 
 
 
343 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2060  lipolytic protein G-D-S-L family  28.43 
 
 
281 aa  57  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3925  GDSL family lipase  28.62 
 
 
253 aa  57  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0072  GDSL family lipase  29.03 
 
 
294 aa  57  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2667  GDSL family lipase  35.18 
 
 
234 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24646  hitchhiker  0.000175501 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1065  lipolytic protein G-D-S-L family  29.75 
 
 
258 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2484  GDSL family lipase  34.95 
 
 
234 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  31.13 
 
 
329 aa  52.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0938  GDSL family lipase  28.57 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23280  lysophospholipase L1-like esterase  28 
 
 
290 aa  51.2  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0910  GDSL family lipase  31.47 
 
 
361 aa  50.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0811  lipolytic protein G-D-S-L family  29.57 
 
 
333 aa  50.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.0157392 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4423  lipolytic protein G-D-S-L family  30.51 
 
 
348 aa  49.7  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0853  GDSL family lipase  31.65 
 
 
361 aa  50.1  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  35.19 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0086  lipolytic protein G-D-S-L family  35.84 
 
 
240 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  28.84 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3268  lipolytic protein G-D-S-L family  32.85 
 
 
232 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3278  hypothetical protein  24.46 
 
 
229 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0436  GDSL family lipase  24.62 
 
 
208 aa  46.2  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.633376  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1486  lipolytic protein G-D-S-L family  32.67 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.585939  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0068  lipolytic protein  35.44 
 
 
247 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523857  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0643  lipolytic protein G-D-S-L family  30.91 
 
 
376 aa  42.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>