33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1486 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1486  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
264 aa  548  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.585939  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3980  lipolytic protein G-D-S-L family  35.85 
 
 
262 aa  159  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235003  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0436  GDSL family lipase  38.76 
 
 
208 aa  152  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.633376  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19520  lysophospholipase L1-like esterase  36.71 
 
 
209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.347124  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3393  lipolytic protein G-D-S-L family  36.36 
 
 
209 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0644196  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1523  lipolytic protein G-D-S-L family  32.87 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06240  lysophospholipase L1-like esterase  35.05 
 
 
216 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2692  lipolytic protein G-D-S-L family  31.58 
 
 
217 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2048  lipolytic protein G-D-S-L family  35.21 
 
 
207 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.137191 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0650  GDSL family lipase  30.14 
 
 
219 aa  93.2  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0553  lipolytic protein G-D-S-L family  28.84 
 
 
214 aa  91.3  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0443  GDSL family lipase  29.7 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.665716  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0794  lipolytic protein G-D-S-L family  33.73 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.774781  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2599  lipolytic protein G-D-S-L family  26.64 
 
 
213 aa  75.1  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  25.7 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  26.18 
 
 
220 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  25.88 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4821  lipolytic protein G-D-S-L family  32.71 
 
 
456 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000350884  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1716  lipolytic protein  25.16 
 
 
194 aa  49.7  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000204836  normal  0.492944 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0828  lipolytic enzyme, G-D-S-L  24.43 
 
 
500 aa  49.7  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0189609  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0455  lipolytic protein G-D-S-L family  26.16 
 
 
325 aa  46.2  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2575  lipolytic protein G-D-S-L family  28.85 
 
 
280 aa  45.8  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  27.36 
 
 
258 aa  45.4  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24010  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  25.32 
 
 
232 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  27.78 
 
 
261 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3112  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.61 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2914  GDSL family lipase  22.84 
 
 
256 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2928  GDSL family lipase  22.84 
 
 
256 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2884  lipolytic enzyme, G-D-S-L  22.84 
 
 
258 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0469503  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  25.82 
 
 
227 aa  42.7  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0965245  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  30.3 
 
 
424 aa  42.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2625  hypothetical protein  27 
 
 
469 aa  42.4  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  24.26 
 
 
201 aa  42  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>