39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4821 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4821  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
456 aa  953    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000350884  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0828  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.3 
 
 
500 aa  217  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0189609  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2606  lipolytic protein G-D-S-L family  30.39 
 
 
457 aa  212  9e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00170788  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1223  lipolytic protein G-D-S-L family  25.63 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0796712  normal  0.271135 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2979  hypothetical protein  26.48 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000369688  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2720  lipolytic protein G-D-S-L family  25.29 
 
 
455 aa  70.9  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0378561  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2599  lipolytic protein G-D-S-L family  27.56 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0553  lipolytic protein G-D-S-L family  25.88 
 
 
214 aa  67  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2692  lipolytic protein G-D-S-L family  25.11 
 
 
217 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0443  GDSL family lipase  22.73 
 
 
213 aa  60.1  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.665716  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  27.09 
 
 
220 aa  60.1  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  34 
 
 
225 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0436  GDSL family lipase  23.94 
 
 
208 aa  56.2  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.633376  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3980  lipolytic protein G-D-S-L family  26.03 
 
 
262 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235003  normal  0.737943 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0794  lipolytic protein G-D-S-L family  26.9 
 
 
209 aa  56.2  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.774781  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4778  lipolytic protein G-D-S-L family  23.32 
 
 
417 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23259  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3393  lipolytic protein G-D-S-L family  24.17 
 
 
209 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0644196  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0650  GDSL family lipase  23.08 
 
 
219 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19520  lysophospholipase L1-like esterase  26.76 
 
 
209 aa  54.3  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.347124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2048  lipolytic protein G-D-S-L family  23.53 
 
 
207 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.137191 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1374  lipolytic protein G-D-S-L family  21.49 
 
 
410 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.221741 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2141  GDSL family lipase  26.24 
 
 
189 aa  50.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.953926  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1486  lipolytic protein G-D-S-L family  32.71 
 
 
264 aa  50.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.585939  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3582  lipolytic protein G-D-S-L family  24 
 
 
241 aa  50.1  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  24.88 
 
 
252 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1523  lipolytic protein G-D-S-L family  22.22 
 
 
220 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2456  lipolytic protein G-D-S-L family  24.75 
 
 
219 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00970732  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06240  lysophospholipase L1-like esterase  30.86 
 
 
216 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  27.56 
 
 
261 aa  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  23.81 
 
 
201 aa  48.5  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  32.53 
 
 
267 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  32.53 
 
 
267 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2263  hypothetical protein  21.74 
 
 
371 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3416  esterase  24 
 
 
188 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0484902  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  32.14 
 
 
267 aa  44.3  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2546  hypothetical protein  21.82 
 
 
239 aa  44.3  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.109536  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3427  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  25.97 
 
 
188 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  26.21 
 
 
250 aa  43.9  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2077  lipolytic protein G-D-S-L family  30.48 
 
 
241 aa  43.5  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>