52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0650 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0650  GDSL family lipase  100 
 
 
219 aa  457  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0553  lipolytic protein G-D-S-L family  49.07 
 
 
214 aa  221  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2692  lipolytic protein G-D-S-L family  51.16 
 
 
217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2599  lipolytic protein G-D-S-L family  44.34 
 
 
213 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2048  lipolytic protein G-D-S-L family  40 
 
 
207 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.137191 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0443  GDSL family lipase  35.1 
 
 
213 aa  125  5e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.665716  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3393  lipolytic protein G-D-S-L family  34.38 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0644196  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0436  GDSL family lipase  31.25 
 
 
208 aa  111  9e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.633376  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3980  lipolytic protein G-D-S-L family  30.63 
 
 
262 aa  102  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235003  normal  0.737943 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0794  lipolytic protein G-D-S-L family  32.61 
 
 
209 aa  100  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.774781  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1523  lipolytic protein G-D-S-L family  29.52 
 
 
220 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19520  lysophospholipase L1-like esterase  33.01 
 
 
209 aa  95.9  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.347124  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1486  lipolytic protein G-D-S-L family  30.14 
 
 
264 aa  93.2  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.585939  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06240  lysophospholipase L1-like esterase  31.75 
 
 
216 aa  92.8  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  29.86 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  26.76 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2606  lipolytic protein G-D-S-L family  29.07 
 
 
457 aa  67  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00170788  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0828  lipolytic enzyme, G-D-S-L  22.37 
 
 
500 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0189609  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02630  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  26.85 
 
 
453 aa  55.8  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2625  hypothetical protein  27.85 
 
 
469 aa  55.1  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4821  lipolytic protein G-D-S-L family  23.08 
 
 
456 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000350884  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  27.71 
 
 
201 aa  54.3  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2077  lipolytic protein G-D-S-L family  24.03 
 
 
241 aa  52.4  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2141  GDSL family lipase  30.71 
 
 
189 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.953926  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3582  lipolytic protein G-D-S-L family  24.55 
 
 
241 aa  51.2  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1829  esterase  29.76 
 
 
188 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0305538  normal  0.13667 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3416  esterase  26.04 
 
 
188 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0484902  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.02 
 
 
183 aa  48.1  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3427  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  28.14 
 
 
188 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3118  esterase  26.63 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1716  lipolytic protein  21.32 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000204836  normal  0.492944 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3112  lipolytic enzyme, G-D-S-L  23.96 
 
 
287 aa  46.2  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  22.96 
 
 
209 aa  45.8  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  21.92 
 
 
261 aa  45.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2456  lipolytic protein G-D-S-L family  27.36 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00970732  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  27.45 
 
 
327 aa  44.3  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  33.33 
 
 
379 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3443  esterase  25 
 
 
188 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.67 
 
 
329 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  28.03 
 
 
269 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  28.28 
 
 
424 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  24.84 
 
 
255 aa  43.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2227  lipolytic protein G-D-S-L family  22.11 
 
 
285 aa  43.5  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  26.84 
 
 
209 aa  43.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3159  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  25.49 
 
 
190 aa  42.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.681628  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  33.33 
 
 
318 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0206  lipolytic protein G-D-S-L family  25.21 
 
 
173 aa  42.4  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  25.56 
 
 
275 aa  42  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0961  GDSL family lipase  26.73 
 
 
439 aa  41.6  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.270574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.33 
 
 
303 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  31.75 
 
 
322 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  26.28 
 
 
275 aa  41.6  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.876075 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>