42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0643 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0643  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
376 aa  724    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0938  GDSL family lipase  54.61 
 
 
348 aa  279  7e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  50.82 
 
 
329 aa  263  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0910  GDSL family lipase  54.3 
 
 
361 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0853  GDSL family lipase  54.49 
 
 
361 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  60 
 
 
343 aa  246  6e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  49.49 
 
 
324 aa  239  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0437  putative secreted protein  46.36 
 
 
347 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0930  lipolytic protein G-D-S-L family  57.83 
 
 
340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0082  lipolytic protein G-D-S-L family  48.21 
 
 
351 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  41.73 
 
 
305 aa  182  8.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3985  GDSL family lipase  48.41 
 
 
298 aa  173  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0334981  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2041  GDSL family lipase  42.05 
 
 
320 aa  171  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23917  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4226  GDSL family lipase  42.63 
 
 
318 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.558892  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4151  lipolytic enzyme, G-D-S-L  42.63 
 
 
318 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11093  hypothetical protein  43.72 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.963411 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4382  GDSL family lipase  42.23 
 
 
318 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4676  GDSL family lipase  43.82 
 
 
320 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.694492 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  42.7 
 
 
368 aa  159  6e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4423  lipolytic protein G-D-S-L family  39.13 
 
 
348 aa  152  8e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1616  lipolytic protein G-D-S-L family  43.05 
 
 
305 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0909  GDSL family lipase  47.69 
 
 
270 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0852  GDSL family lipase  47.18 
 
 
270 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3837  lipolytic protein G-D-S-L family  41.05 
 
 
204 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.490417  normal  0.0238456 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1853  GDSL family lipase  26.36 
 
 
263 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211701 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  30.58 
 
 
219 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2140  lipolytic protein G-D-S-L family  35.18 
 
 
207 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  33.15 
 
 
244 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  29.85 
 
 
213 aa  50.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01055  hypothetical protein  27.11 
 
 
217 aa  49.7  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.411202  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  26.6 
 
 
216 aa  49.3  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  22.82 
 
 
196 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  23.53 
 
 
196 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  23.04 
 
 
211 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3224  lipolytic protein G-D-S-L family  38.27 
 
 
231 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3405  lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  28.57 
 
 
244 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.24 
 
 
270 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  22.55 
 
 
197 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  26.25 
 
 
1072 aa  43.9  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  22.55 
 
 
197 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0068  lipolytic protein  32.78 
 
 
247 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523857  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2616  GDSL family lipase  28.27 
 
 
225 aa  42.7  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>