66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3224 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3224  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
231 aa  474  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2976  lipolytic protein G-D-S-L family  79.22 
 
 
231 aa  361  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  30.05 
 
 
223 aa  61.6  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  28.96 
 
 
213 aa  59.7  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1599  lipolytic protein G-D-S-L family  32.48 
 
 
222 aa  59.3  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  30.77 
 
 
226 aa  58.5  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  29.08 
 
 
223 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  25.24 
 
 
212 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  30.83 
 
 
252 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  29.15 
 
 
248 aa  56.2  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  29.67 
 
 
240 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  27.23 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.04 
 
 
226 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  32.81 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  32.81 
 
 
216 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  33.9 
 
 
202 aa  53.5  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  31.07 
 
 
195 aa  53.1  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  28.42 
 
 
201 aa  52.4  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  31.06 
 
 
234 aa  52.4  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  28.57 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  36.73 
 
 
270 aa  49.3  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  30.77 
 
 
218 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  27.32 
 
 
219 aa  48.5  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  31.45 
 
 
213 aa  48.5  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  27.27 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  34.31 
 
 
270 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1250  arylesterase  27.27 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6500  lipolytic protein G-D-S-L family  28.57 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  28.26 
 
 
204 aa  47.4  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  33.01 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  33.33 
 
 
209 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  25.69 
 
 
200 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  30.67 
 
 
214 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  29.19 
 
 
257 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  32.56 
 
 
219 aa  47  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  30.13 
 
 
240 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  34.95 
 
 
343 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0143  lipolytic protein G-D-S-L family  27.27 
 
 
305 aa  46.6  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  33.33 
 
 
204 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  27.98 
 
 
210 aa  46.6  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  32 
 
 
210 aa  45.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  28.86 
 
 
266 aa  45.8  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  25.81 
 
 
216 aa  45.4  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  32.35 
 
 
241 aa  44.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0643  lipolytic protein G-D-S-L family  38.27 
 
 
376 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  28.91 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  26.36 
 
 
324 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  32.35 
 
 
241 aa  44.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  26.03 
 
 
200 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1401  arylesterase  27.96 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0437  putative secreted protein  37.97 
 
 
347 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.82 
 
 
211 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1973  arylesterase  27.91 
 
 
208 aa  43.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  29.13 
 
 
255 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5220  lipolytic protein  34.68 
 
 
224 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.01 
 
 
204 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  25.6 
 
 
215 aa  42.7  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  32.99 
 
 
209 aa  42.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  31.09 
 
 
202 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1907  arylesterase  33.05 
 
 
225 aa  42  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0973047  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1837  lysophospholipase  33.63 
 
 
201 aa  42  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal  0.074561 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1944  acyl-CoA thioesterase, putative  32.48 
 
 
210 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3360  acyl-CoA thioesterase I  32.48 
 
 
226 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.323811  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3386  hypothetical protein  24.18 
 
 
261 aa  41.6  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1219  acyl-CoA thioesterase, putative  32.48 
 
 
226 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1451  acyl-CoA thioesterase I  32.48 
 
 
210 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0796987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>