125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2456 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2456  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
219 aa  447  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00970732  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  69.08 
 
 
225 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  57.59 
 
 
220 aa  248  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2692  lipolytic protein G-D-S-L family  31.11 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19520  lysophospholipase L1-like esterase  33.33 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.347124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3118  esterase  29.85 
 
 
188 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3427  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  29.35 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0436  GDSL family lipase  26.63 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.633376  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3443  esterase  29.35 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4821  lipolytic protein G-D-S-L family  26.11 
 
 
456 aa  70.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000350884  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3393  lipolytic protein G-D-S-L family  30.26 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0644196  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2141  GDSL family lipase  27.27 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.953926  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0443  GDSL family lipase  28.11 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.665716  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0650  GDSL family lipase  27.36 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0553  lipolytic protein G-D-S-L family  24.89 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02630  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  25.52 
 
 
453 aa  65.5  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2599  lipolytic protein G-D-S-L family  25.93 
 
 
213 aa  65.1  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2606  lipolytic protein G-D-S-L family  27.88 
 
 
457 aa  64.7  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00170788  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3416  esterase  26.37 
 
 
188 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0484902  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  25.5 
 
 
275 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1523  lipolytic protein G-D-S-L family  28.57 
 
 
220 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  25.5 
 
 
286 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1829  esterase  27.64 
 
 
188 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0305538  normal  0.13667 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3582  lipolytic protein G-D-S-L family  24.58 
 
 
241 aa  61.6  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  26.54 
 
 
300 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3998  hypothetical protein  26.34 
 
 
528 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00171842 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1886  lysophospholipase L1 related esterase  28.72 
 
 
187 aa  59.7  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0143841  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  24.27 
 
 
269 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0794  lipolytic protein G-D-S-L family  30.18 
 
 
209 aa  59.3  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.774781  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2954  lipolytic protein G-D-S-L family  26.63 
 
 
319 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06240  lysophospholipase L1-like esterase  25.71 
 
 
216 aa  58.9  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  25 
 
 
275 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2048  lipolytic protein G-D-S-L family  26.32 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.137191 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2630  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.13 
 
 
198 aa  56.2  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0895129  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  26.53 
 
 
447 aa  56.2  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4413  GDSL family lipase  25.25 
 
 
266 aa  55.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  26.44 
 
 
379 aa  55.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1486  lipolytic protein G-D-S-L family  29.45 
 
 
264 aa  55.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.585939  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3930  GDSL family lipase  27.32 
 
 
283 aa  55.5  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  25.25 
 
 
279 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  24.71 
 
 
318 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  30.63 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  24.88 
 
 
303 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  24.77 
 
 
327 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4136  hypothetical protein  25.45 
 
 
448 aa  53.9  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0594523  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3980  lipolytic protein G-D-S-L family  28.3 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235003  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19770  lysophospholipase L1-like esterase  27.75 
 
 
255 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  hitchhiker  0.000837214 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  28.08 
 
 
204 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1065  lipolytic protein G-D-S-L family  24.26 
 
 
258 aa  52.4  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.29 
 
 
183 aa  52.8  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0386  lipolytic protein G-D-S-L family  26.26 
 
 
258 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2546  hypothetical protein  25.48 
 
 
239 aa  51.6  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.109536  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.68 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0023  GDSL family lipase  31.33 
 
 
259 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2263  hypothetical protein  23.9 
 
 
371 aa  50.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  25 
 
 
277 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  33.07 
 
 
261 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3925  GDSL family lipase  26.21 
 
 
253 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  23.47 
 
 
322 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  24.7 
 
 
267 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  24.71 
 
 
267 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  24.7 
 
 
267 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  24.88 
 
 
238 aa  49.3  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2175  lipolytic protein G-D-S-L family  23.67 
 
 
249 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.045511 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2979  hypothetical protein  26.79 
 
 
295 aa  48.9  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000369688  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06064  GDSL Lipase/Acylhydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G08920)  25 
 
 
257 aa  48.5  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3112  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.4 
 
 
287 aa  48.5  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.57 
 
 
204 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0828  lipolytic enzyme, G-D-S-L  21.72 
 
 
500 aa  48.5  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0189609  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0665  hypothetical protein  23.75 
 
 
333 aa  48.9  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3870  putative lipase  25.42 
 
 
239 aa  48.9  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.749883  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1774  lipolytic protein G-D-S-L family  23.41 
 
 
229 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3727  lipolytic protein G-D-S-L family  26.21 
 
 
257 aa  48.5  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0731  lipolytic protein G-D-S-L family  23.56 
 
 
265 aa  48.5  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0072  GDSL family lipase  25.13 
 
 
294 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.5 
 
 
831 aa  47.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2134  GDSL family lipase  35.9 
 
 
248 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.306238  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  23.83 
 
 
327 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1223  lipolytic protein G-D-S-L family  25.68 
 
 
316 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0796712  normal  0.271135 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1716  lipolytic protein  25.62 
 
 
194 aa  47  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000204836  normal  0.492944 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.12 
 
 
225 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  20.3 
 
 
261 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2070  lipolytic protein G-D-S-L family  24.19 
 
 
395 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.397214  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0263  lipolytic protein G-D-S-L family  26.67 
 
 
301 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3372  lipolytic protein G-D-S-L family  27.96 
 
 
396 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06060  lysophospholipase L1-like esterase  25 
 
 
297 aa  47.4  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105705  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0578  lipolytic protein G-D-S-L family  26.42 
 
 
228 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  25.74 
 
 
260 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  23.88 
 
 
201 aa  46.2  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4335  hypothetical protein  26.67 
 
 
230 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6531  hypothetical protein  22.71 
 
 
262 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.0269756 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2077  lipolytic protein G-D-S-L family  24.48 
 
 
241 aa  46.6  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3065  lipolytic protein G-D-S-L family  25.98 
 
 
262 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  24.09 
 
 
329 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  40.28 
 
 
252 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  27.22 
 
 
251 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1973  arylesterase  30.08 
 
 
208 aa  45.8  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2720  lipolytic protein G-D-S-L family  25.43 
 
 
455 aa  45.1  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0378561  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  23.5 
 
 
250 aa  45.1  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3442  lipolytic enzyme, G-D-S-L  24.06 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>