111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2546 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2546  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  489  1e-137  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.109536  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  57.14 
 
 
230 aa  263  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4506  lipolytic protein G-D-S-L family  57.14 
 
 
230 aa  263  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3442  lipolytic enzyme, G-D-S-L  55.71 
 
 
232 aa  250  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1774  lipolytic protein G-D-S-L family  55.24 
 
 
229 aa  249  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4796  lipolytic protein  55.56 
 
 
239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0762  lipolytic protein G-D-S-L family  51.6 
 
 
222 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3589  G-D-S-L family lipolytic protein  51.67 
 
 
237 aa  232  5e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474634  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07831  lysophospholipase L1 and related esterase  43.48 
 
 
220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00632234 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14281  lysophospholipase L1  47.34 
 
 
225 aa  188  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0102  arylesterase  40.87 
 
 
215 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0670  hypothetical protein  41.51 
 
 
214 aa  180  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212223  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07271  lysophospholipase L1 and related esterases  40.87 
 
 
215 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0199711  normal  0.0101473 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07231  lysophospholipase L1 and related esterase  40.57 
 
 
214 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.613017  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07431  lysophospholipase L1 and related esterase  41.59 
 
 
214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.833835  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07251  lysophospholipase L1  41.04 
 
 
214 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.537242  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1291  hypothetical protein  41.75 
 
 
228 aa  165  6.9999999999999995e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1186  hypothetical protein  43.48 
 
 
223 aa  154  9e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.289249  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3904  lipolytic protein  29.52 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1722  GDSL family lipase  28.71 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.862782  normal  0.0152444 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3345  lipolytic protein G-D-S-L family  28.24 
 
 
207 aa  62  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00984287  normal  0.068906 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3233  hypothetical protein  27.92 
 
 
184 aa  61.2  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.826377  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2845  lipolytic protein G-D-S-L family  30.26 
 
 
199 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.277624  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1227  lipolytic protein G-D-S-L family  28.19 
 
 
200 aa  55.5  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1250  arylesterase  25.73 
 
 
208 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1812  lipolytic protein G-D-S-L family  24.77 
 
 
264 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000302668  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2884  lipolytic enzyme, G-D-S-L  24.79 
 
 
258 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0469503  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2928  GDSL family lipase  25.32 
 
 
256 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2914  GDSL family lipase  25.32 
 
 
256 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1355  GDSL family lipase  25 
 
 
184 aa  53.1  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260429  normal  0.647908 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06064  GDSL Lipase/Acylhydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G08920)  28.28 
 
 
257 aa  52.8  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1907  arylesterase  25.59 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0973047  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1837  lysophospholipase  25.59 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal  0.074561 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  24.06 
 
 
205 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  25.94 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  23.94 
 
 
216 aa  50.1  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  26.87 
 
 
201 aa  50.1  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2484  lipolytic protein G-D-S-L family  27.23 
 
 
265 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  24.29 
 
 
223 aa  50.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5194  GDSL family lipase  25.23 
 
 
269 aa  49.7  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  23.58 
 
 
202 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0773  GDSL family lipase  31.48 
 
 
308 aa  49.3  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.27 
 
 
225 aa  49.3  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5524  putative lipase/acylhydrolase  23.3 
 
 
269 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120317  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0686  acyl-CoA thioesterase I precursor  26.26 
 
 
206 aa  48.9  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1157  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  25.89 
 
 
196 aa  48.9  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.987019  hitchhiker  0.000093812 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1973  arylesterase  25.82 
 
 
208 aa  48.5  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1526  GDSL family lipase  24.77 
 
 
206 aa  48.5  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0224358  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1942  GDSL family lipase  24.19 
 
 
222 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5530  lipase/acylhydrolase, putative  22.89 
 
 
269 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0254  lipolytic protein G-D-S-L family  25.24 
 
 
254 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3922  GDSL family lipase  24.38 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5580  putative lipase/acylhydrolase  23.38 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  26.44 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5253  lipase/acylhydrolase  22.89 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5082  lipase/acylhydrolase  22.89 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000543615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5099  lipase/acylhydrolase  22.89 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5220  lipolytic protein  25.12 
 
 
224 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5651  lipase/acylhydrolase  22.89 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0761  lysophospholipase L1 related esterase  22.75 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1919  GDSL family lipase  24.19 
 
 
222 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  27.45 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3021  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  27.81 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.116917  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1271  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  27.81 
 
 
216 aa  47.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.934354  normal  0.745866 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3159  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  27.27 
 
 
190 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.681628  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  22.86 
 
 
196 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5496  putative lipase/acylhydrolase  22.89 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  26.02 
 
 
195 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6160  lipolytic enzyme, G-D-S-L  24.17 
 
 
184 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  26.63 
 
 
208 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  26.63 
 
 
208 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1252  lipolytic protein G-D-S-L family  19.63 
 
 
197 aa  46.2  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1888  GDSL family lipase  23.78 
 
 
205 aa  46.2  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.172385  normal  0.431638 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1589  lipolytic protein G-D-S-L family  25 
 
 
264 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0691726  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2311  acyl-CoA thioesterase I  23.7 
 
 
226 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328666  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  24.89 
 
 
267 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  24.89 
 
 
267 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  24.89 
 
 
267 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2141  GDSL family lipase  25.49 
 
 
192 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.336589  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5427  putative lipase/acylhydrolase  22.82 
 
 
269 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.387496  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  22.54 
 
 
197 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1451  acyl-CoA thioesterase I  24.06 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0796987  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2468  acyl-CoA thioesterase I  24.06 
 
 
232 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2130  acyl-CoA thioesterase I  23.58 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0925332  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3031  arylesterase  29.03 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0119221  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1944  acyl-CoA thioesterase, putative  24.06 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19520  lysophospholipase L1-like esterase  25.35 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.347124  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3360  acyl-CoA thioesterase I  23.7 
 
 
226 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.323811  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2349  acyl-CoA thioesterase I  24.06 
 
 
226 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342974  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1219  acyl-CoA thioesterase, putative  23.7 
 
 
226 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  22.44 
 
 
220 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1384  arylesterase  24.52 
 
 
201 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.015235  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3020  GDSL family lipase  31.15 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.242695 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2822  GDSL family lipase  22.82 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0817  lipolytic protein G-D-S-L family  25.24 
 
 
331 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00788434 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2175  lipolytic protein G-D-S-L family  22.71 
 
 
249 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.045511 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1122  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  22.96 
 
 
197 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0118083  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4821  lipolytic protein G-D-S-L family  21.82 
 
 
456 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000350884  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0488  GDSL family lipase  26.29 
 
 
203 aa  43.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307636  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  38.14 
 
 
296 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>